Protein–RNA interactions for Protein: P06753

TPM3, Tropomyosin alpha-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM3P06753 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TPM3P06753 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TPM3P06753 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TPM3P06753 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TPM3P06753 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TPM3P06753 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TPM3P06753 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TPM3P06753 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TPM3P06753 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TPM3P06753 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TPM3P06753 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TPM3P06753 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TPM3P06753 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TPM3P06753 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TPM3P06753 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TPM3P06753 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TPM3P06753 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TPM3P06753 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TPM3P06753 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TPM3P06753 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TPM3P06753 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TPM3P06753 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TPM3P06753 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TPM3P06753 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TPM3P06753 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
TPM3P06753 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TPM3P06753 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TPM3P06753 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TPM3P06753 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TPM3P06753 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TPM3P06753 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TPM3P06753 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TPM3P06753 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TPM3P06753 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TPM3P06753 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TPM3P06753 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TPM3P06753 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TPM3P06753 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TPM3P06753 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TPM3P06753 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TPM3P06753 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TPM3P06753 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TPM3P06753 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TPM3P06753 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TPM3P06753 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
TPM3P06753 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TPM3P06753 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TPM3P06753 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TPM3P06753 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TPM3P06753 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TPM3P06753 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TPM3P06753 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TPM3P06753 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TPM3P06753 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TPM3P06753 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TPM3P06753 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TPM3P06753 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TPM3P06753 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TPM3P06753 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TPM3P06753 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TPM3P06753 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TPM3P06753 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TPM3P06753 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TPM3P06753 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TPM3P06753 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TPM3P06753 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TPM3P06753 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TPM3P06753 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TPM3P06753 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TPM3P06753 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TPM3P06753 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TPM3P06753 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TPM3P06753 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TPM3P06753 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TPM3P06753 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TPM3P06753 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TPM3P06753 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TPM3P06753 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TPM3P06753 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TPM3P06753 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TPM3P06753 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TPM3P06753 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TPM3P06753 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TPM3P06753 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TPM3P06753 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TPM3P06753 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TPM3P06753 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TPM3P06753 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
TPM3P06753 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
TPM3P06753 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TPM3P06753 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TPM3P06753 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TPM3P06753 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TPM3P06753 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TPM3P06753 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TPM3P06753 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TPM3P06753 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TPM3P06753 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TPM3P06753 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TPM3P06753 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms