Protein–RNA interactions for Protein: P06344

H-2 class II histocompatibility antigen, A-U beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06344 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
P06344 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
P06344 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P06344 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P06344 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
P06344 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P06344 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P06344 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P06344 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
P06344 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
P06344 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P06344 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P06344 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P06344 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
P06344 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P06344 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P06344 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
P06344 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P06344 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
P06344 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
P06344 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P06344 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P06344 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
P06344 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
P06344 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
P06344 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
P06344 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
P06344 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
P06344 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P06344 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
P06344 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
P06344 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
P06344 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
P06344 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
P06344 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P06344 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P06344 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P06344 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P06344 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P06344 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
P06344 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P06344 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
P06344 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
P06344 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P06344 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P06344 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P06344 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P06344 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P06344 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P06344 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P06344 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
P06344 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P06344 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
P06344 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P06344 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
P06344 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
P06344 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P06344 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P06344 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
P06344 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P06344 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P06344 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
P06344 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
P06344 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
P06344 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P06344 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P06344 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P06344 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P06344 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P06344 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P06344 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P06344 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P06344 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P06344 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P06344 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P06344 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P06344 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
P06344 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P06344 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P06344 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P06344 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P06344 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
P06344 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
P06344 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
P06344 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
P06344 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P06344 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
P06344 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
P06344 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
P06344 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
P06344 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
P06344 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
P06344 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
P06344 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P06344 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
P06344 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
P06344 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P06344 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
P06344 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
P06344 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms