Protein–RNA interactions for Protein: P05160

F13B, Coagulation factor XIII B chain, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13BP05160 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
F13BP05160 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
F13BP05160 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
F13BP05160 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
F13BP05160 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
F13BP05160 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
F13BP05160 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
F13BP05160 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
F13BP05160 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
F13BP05160 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
F13BP05160 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
F13BP05160 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
F13BP05160 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
F13BP05160 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
F13BP05160 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
F13BP05160 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
F13BP05160 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
F13BP05160 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
F13BP05160 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
F13BP05160 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
F13BP05160 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
F13BP05160 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
F13BP05160 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
F13BP05160 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
F13BP05160 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
F13BP05160 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
F13BP05160 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
F13BP05160 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
F13BP05160 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
F13BP05160 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
F13BP05160 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
F13BP05160 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
F13BP05160 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
F13BP05160 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
F13BP05160 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
F13BP05160 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
F13BP05160 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
F13BP05160 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
F13BP05160 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
F13BP05160 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
F13BP05160 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
F13BP05160 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
F13BP05160 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
F13BP05160 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
F13BP05160 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
F13BP05160 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
F13BP05160 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
F13BP05160 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
F13BP05160 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
F13BP05160 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
F13BP05160 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
F13BP05160 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
F13BP05160 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
F13BP05160 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
F13BP05160 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
F13BP05160 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
F13BP05160 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
F13BP05160 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
F13BP05160 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
F13BP05160 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
F13BP05160 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
F13BP05160 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
F13BP05160 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
F13BP05160 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
F13BP05160 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
F13BP05160 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
F13BP05160 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
F13BP05160 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
F13BP05160 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
F13BP05160 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
F13BP05160 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
F13BP05160 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
F13BP05160 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
F13BP05160 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
F13BP05160 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
F13BP05160 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
F13BP05160 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
F13BP05160 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
F13BP05160 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
F13BP05160 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
F13BP05160 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
F13BP05160 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
F13BP05160 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
F13BP05160 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
F13BP05160 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
F13BP05160 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
F13BP05160 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
F13BP05160 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
F13BP05160 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
F13BP05160 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
F13BP05160 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
F13BP05160 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
F13BP05160 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
F13BP05160 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
F13BP05160 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
F13BP05160 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
F13BP05160 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
F13BP05160 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
F13BP05160 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
F13BP05160 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms