Protein–RNA interactions for Protein: P04433

IGKV3-11, Immunoglobulin kappa variable 3-11, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3-11P04433 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGKV3-11P04433 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGKV3-11P04433 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGKV3-11P04433 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IGKV3-11P04433 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IGKV3-11P04433 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IGKV3-11P04433 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IGKV3-11P04433 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IGKV3-11P04433 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IGKV3-11P04433 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IGKV3-11P04433 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IGKV3-11P04433 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
IGKV3-11P04433 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IGKV3-11P04433 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
IGKV3-11P04433 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IGKV3-11P04433 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IGKV3-11P04433 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
IGKV3-11P04433 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IGKV3-11P04433 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IGKV3-11P04433 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IGKV3-11P04433 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGKV3-11P04433 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGKV3-11P04433 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
IGKV3-11P04433 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGKV3-11P04433 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGKV3-11P04433 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGKV3-11P04433 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGKV3-11P04433 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGKV3-11P04433 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGKV3-11P04433 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGKV3-11P04433 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGKV3-11P04433 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGKV3-11P04433 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGKV3-11P04433 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGKV3-11P04433 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGKV3-11P04433 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGKV3-11P04433 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IGKV3-11P04433 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IGKV3-11P04433 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IGKV3-11P04433 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IGKV3-11P04433 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IGKV3-11P04433 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IGKV3-11P04433 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IGKV3-11P04433 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IGKV3-11P04433 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IGKV3-11P04433 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
IGKV3-11P04433 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGKV3-11P04433 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGKV3-11P04433 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGKV3-11P04433 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
IGKV3-11P04433 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IGKV3-11P04433 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IGKV3-11P04433 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IGKV3-11P04433 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IGKV3-11P04433 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IGKV3-11P04433 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IGKV3-11P04433 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IGKV3-11P04433 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IGKV3-11P04433 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IGKV3-11P04433 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IGKV3-11P04433 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IGKV3-11P04433 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IGKV3-11P04433 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IGKV3-11P04433 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IGKV3-11P04433 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IGKV3-11P04433 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IGKV3-11P04433 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IGKV3-11P04433 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IGKV3-11P04433 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IGKV3-11P04433 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IGKV3-11P04433 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IGKV3-11P04433 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IGKV3-11P04433 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IGKV3-11P04433 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IGKV3-11P04433 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IGKV3-11P04433 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IGKV3-11P04433 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
IGKV3-11P04433 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IGKV3-11P04433 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IGKV3-11P04433 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
IGKV3-11P04433 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
IGKV3-11P04433 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGKV3-11P04433 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGKV3-11P04433 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGKV3-11P04433 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGKV3-11P04433 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGKV3-11P04433 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGKV3-11P04433 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGKV3-11P04433 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
IGKV3-11P04433 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGKV3-11P04433 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGKV3-11P04433 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGKV3-11P04433 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
IGKV3-11P04433 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGKV3-11P04433 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IGKV3-11P04433 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IGKV3-11P04433 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IGKV3-11P04433 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IGKV3-11P04433 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IGKV3-11P04433 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms