Protein–RNA interactions for Protein: P04342

Crygd, Gamma-crystallin D, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrygdP04342 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CrygdP04342 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CrygdP04342 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CrygdP04342 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CrygdP04342 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CrygdP04342 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CrygdP04342 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CrygdP04342 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CrygdP04342 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CrygdP04342 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CrygdP04342 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CrygdP04342 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CrygdP04342 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CrygdP04342 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CrygdP04342 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CrygdP04342 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CrygdP04342 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CrygdP04342 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CrygdP04342 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CrygdP04342 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CrygdP04342 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CrygdP04342 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CrygdP04342 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CrygdP04342 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CrygdP04342 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CrygdP04342 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CrygdP04342 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CrygdP04342 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CrygdP04342 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CrygdP04342 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CrygdP04342 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CrygdP04342 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CrygdP04342 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CrygdP04342 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CrygdP04342 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CrygdP04342 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrygdP04342 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrygdP04342 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrygdP04342 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrygdP04342 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrygdP04342 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CrygdP04342 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CrygdP04342 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CrygdP04342 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CrygdP04342 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CrygdP04342 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CrygdP04342 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CrygdP04342 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CrygdP04342 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CrygdP04342 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CrygdP04342 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CrygdP04342 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CrygdP04342 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CrygdP04342 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrygdP04342 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrygdP04342 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CrygdP04342 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CrygdP04342 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CrygdP04342 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CrygdP04342 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CrygdP04342 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CrygdP04342 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CrygdP04342 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CrygdP04342 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CrygdP04342 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CrygdP04342 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CrygdP04342 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CrygdP04342 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CrygdP04342 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CrygdP04342 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CrygdP04342 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CrygdP04342 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CrygdP04342 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CrygdP04342 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CrygdP04342 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CrygdP04342 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CrygdP04342 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CrygdP04342 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CrygdP04342 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CrygdP04342 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CrygdP04342 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CrygdP04342 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CrygdP04342 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CrygdP04342 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CrygdP04342 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CrygdP04342 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CrygdP04342 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CrygdP04342 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CrygdP04342 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CrygdP04342 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CrygdP04342 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CrygdP04342 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CrygdP04342 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CrygdP04342 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CrygdP04342 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CrygdP04342 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CrygdP04342 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CrygdP04342 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CrygdP04342 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CrygdP04342 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms