Protein–RNA interactions for Protein: P04156

PRNP, Major prion protein, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRNPP04156 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRNPP04156 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRNPP04156 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRNPP04156 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRNPP04156 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRNPP04156 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRNPP04156 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRNPP04156 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRNPP04156 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRNPP04156 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRNPP04156 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRNPP04156 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRNPP04156 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRNPP04156 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRNPP04156 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRNPP04156 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRNPP04156 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRNPP04156 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRNPP04156 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRNPP04156 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRNPP04156 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRNPP04156 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PRNPP04156 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PRNPP04156 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PRNPP04156 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRNPP04156 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRNPP04156 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRNPP04156 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRNPP04156 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRNPP04156 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRNPP04156 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRNPP04156 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRNPP04156 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRNPP04156 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRNPP04156 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PRNPP04156 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRNPP04156 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRNPP04156 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRNPP04156 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRNPP04156 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRNPP04156 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRNPP04156 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRNPP04156 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRNPP04156 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRNPP04156 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRNPP04156 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRNPP04156 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRNPP04156 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRNPP04156 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRNPP04156 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRNPP04156 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRNPP04156 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRNPP04156 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRNPP04156 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRNPP04156 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRNPP04156 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRNPP04156 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PRNPP04156 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRNPP04156 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRNPP04156 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRNPP04156 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PRNPP04156 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRNPP04156 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRNPP04156 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRNPP04156 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRNPP04156 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRNPP04156 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRNPP04156 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRNPP04156 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRNPP04156 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRNPP04156 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRNPP04156 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRNPP04156 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRNPP04156 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRNPP04156 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRNPP04156 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRNPP04156 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRNPP04156 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRNPP04156 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRNPP04156 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRNPP04156 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRNPP04156 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRNPP04156 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRNPP04156 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRNPP04156 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PRNPP04156 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRNPP04156 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRNPP04156 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRNPP04156 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRNPP04156 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRNPP04156 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRNPP04156 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PRNPP04156 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRNPP04156 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PRNPP04156 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRNPP04156 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRNPP04156 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRNPP04156 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRNPP04156 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRNPP04156 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms