Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CSF2P04141 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CSF2P04141 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CSF2P04141 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CSF2P04141 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSF2P04141 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSF2P04141 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CSF2P04141 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSF2P04141 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CSF2P04141 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CSF2P04141 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CSF2P04141 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CSF2P04141 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CSF2P04141 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CSF2P04141 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CSF2P04141 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CSF2P04141 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CSF2P04141 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CSF2P04141 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CSF2P04141 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CSF2P04141 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CSF2P04141 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CSF2P04141 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CSF2P04141 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CSF2P04141 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CSF2P04141 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSF2P04141 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSF2P04141 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSF2P04141 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CSF2P04141 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSF2P04141 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CSF2P04141 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSF2P04141 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSF2P04141 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CSF2P04141 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CSF2P04141 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CSF2P04141 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CSF2P04141 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CSF2P04141 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CSF2P04141 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CSF2P04141 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CSF2P04141 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CSF2P04141 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CSF2P04141 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CSF2P04141 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CSF2P04141 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CSF2P04141 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CSF2P04141 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CSF2P04141 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSF2P04141 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSF2P04141 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSF2P04141 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSF2P04141 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CSF2P04141 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CSF2P04141 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CSF2P04141 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CSF2P04141 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CSF2P04141 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CSF2P04141 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSF2P04141 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSF2P04141 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSF2P04141 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSF2P04141 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSF2P04141 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSF2P04141 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CSF2P04141 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CSF2P04141 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CSF2P04141 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CSF2P04141 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CSF2P04141 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CSF2P04141 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CSF2P04141 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CSF2P04141 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CSF2P04141 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CSF2P04141 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CSF2P04141 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CSF2P04141 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CSF2P04141 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSF2P04141 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSF2P04141 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSF2P04141 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSF2P04141 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CSF2P04141 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSF2P04141 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSF2P04141 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSF2P04141 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSF2P04141 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSF2P04141 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSF2P04141 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSF2P04141 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSF2P04141 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSF2P04141 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSF2P04141 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CSF2P04141 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSF2P04141 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSF2P04141 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CSF2P04141 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CSF2P04141 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CSF2P04141 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CSF2P04141 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms