Protein–RNA interactions for Protein: P02746

C1QB, Complement C1q subcomponent subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QBP02746 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QBP02746 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QBP02746 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QBP02746 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QBP02746 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QBP02746 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QBP02746 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QBP02746 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QBP02746 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
C1QBP02746 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1QBP02746 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1QBP02746 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QBP02746 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QBP02746 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QBP02746 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1QBP02746 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1QBP02746 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QBP02746 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QBP02746 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QBP02746 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QBP02746 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QBP02746 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1QBP02746 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1QBP02746 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C1QBP02746 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1QBP02746 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1QBP02746 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1QBP02746 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1QBP02746 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1QBP02746 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1QBP02746 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1QBP02746 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1QBP02746 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1QBP02746 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1QBP02746 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1QBP02746 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1QBP02746 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1QBP02746 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1QBP02746 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1QBP02746 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1QBP02746 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C1QBP02746 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1QBP02746 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1QBP02746 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1QBP02746 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1QBP02746 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1QBP02746 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1QBP02746 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1QBP02746 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1QBP02746 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1QBP02746 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1QBP02746 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1QBP02746 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
C1QBP02746 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1QBP02746 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1QBP02746 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1QBP02746 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1QBP02746 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1QBP02746 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1QBP02746 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1QBP02746 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1QBP02746 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1QBP02746 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1QBP02746 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1QBP02746 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1QBP02746 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1QBP02746 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1QBP02746 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1QBP02746 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1QBP02746 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QBP02746 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QBP02746 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1QBP02746 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1QBP02746 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1QBP02746 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1QBP02746 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1QBP02746 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1QBP02746 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1QBP02746 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1QBP02746 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1QBP02746 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1QBP02746 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1QBP02746 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1QBP02746 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QBP02746 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QBP02746 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QBP02746 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QBP02746 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QBP02746 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QBP02746 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1QBP02746 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1QBP02746 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QBP02746 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QBP02746 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QBP02746 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QBP02746 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QBP02746 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QBP02746 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QBP02746 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QBP02746 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms