Protein–RNA interactions for Protein: P01898

H2-Q10, H-2 class I histocompatibility antigen, Q10 alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q10P01898 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
H2-Q10P01898 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
H2-Q10P01898 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
H2-Q10P01898 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
H2-Q10P01898 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
H2-Q10P01898 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
H2-Q10P01898 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
H2-Q10P01898 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
H2-Q10P01898 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
H2-Q10P01898 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
H2-Q10P01898 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
H2-Q10P01898 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
H2-Q10P01898 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
H2-Q10P01898 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
H2-Q10P01898 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
H2-Q10P01898 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
H2-Q10P01898 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
H2-Q10P01898 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
H2-Q10P01898 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
H2-Q10P01898 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
H2-Q10P01898 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
H2-Q10P01898 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
H2-Q10P01898 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
H2-Q10P01898 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
H2-Q10P01898 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
H2-Q10P01898 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
H2-Q10P01898 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
H2-Q10P01898 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
H2-Q10P01898 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
H2-Q10P01898 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
H2-Q10P01898 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
H2-Q10P01898 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
H2-Q10P01898 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
H2-Q10P01898 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
H2-Q10P01898 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
H2-Q10P01898 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
H2-Q10P01898 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
H2-Q10P01898 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
H2-Q10P01898 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
H2-Q10P01898 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
H2-Q10P01898 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
H2-Q10P01898 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
H2-Q10P01898 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
H2-Q10P01898 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
H2-Q10P01898 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
H2-Q10P01898 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
H2-Q10P01898 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
H2-Q10P01898 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
H2-Q10P01898 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
H2-Q10P01898 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
H2-Q10P01898 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
H2-Q10P01898 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
H2-Q10P01898 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
H2-Q10P01898 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
H2-Q10P01898 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
H2-Q10P01898 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
H2-Q10P01898 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
H2-Q10P01898 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
H2-Q10P01898 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
H2-Q10P01898 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
H2-Q10P01898 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
H2-Q10P01898 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
H2-Q10P01898 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
H2-Q10P01898 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
H2-Q10P01898 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
H2-Q10P01898 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
H2-Q10P01898 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
H2-Q10P01898 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
H2-Q10P01898 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
H2-Q10P01898 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
H2-Q10P01898 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
H2-Q10P01898 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
H2-Q10P01898 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
H2-Q10P01898 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
H2-Q10P01898 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
H2-Q10P01898 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
H2-Q10P01898 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
H2-Q10P01898 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
H2-Q10P01898 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
H2-Q10P01898 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
H2-Q10P01898 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
H2-Q10P01898 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
H2-Q10P01898 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
H2-Q10P01898 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
H2-Q10P01898 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
H2-Q10P01898 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
H2-Q10P01898 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
H2-Q10P01898 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
H2-Q10P01898 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
H2-Q10P01898 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
H2-Q10P01898 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
H2-Q10P01898 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2-Q10P01898 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
H2-Q10P01898 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
H2-Q10P01898 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2-Q10P01898 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2-Q10P01898 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2-Q10P01898 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2-Q10P01898 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2-Q10P01898 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms