Protein–RNA interactions for Protein: P01837

Ig kappa chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01837 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01837 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01837 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01837 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01837 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
P01837 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
P01837 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
P01837 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
P01837 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
P01837 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
P01837 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01837 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01837 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01837 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01837 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01837 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01837 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01837 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01837 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01837 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01837 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01837 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
P01837 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01837 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01837 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01837 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01837 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01837 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01837 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01837 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01837 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01837 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01837 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01837 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01837 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01837 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01837 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01837 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01837 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01837 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01837 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01837 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01837 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01837 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01837 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01837 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01837 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01837 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
P01837 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01837 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01837 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01837 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01837 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01837 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01837 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01837 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01837 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
P01837 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01837 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01837 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01837 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
P01837 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
P01837 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
P01837 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01837 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01837 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01837 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01837 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01837 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01837 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01837 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01837 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01837 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01837 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01837 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01837 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01837 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01837 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01837 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01837 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01837 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01837 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01837 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01837 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01837 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
P01837 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01837 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01837 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01837 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01837 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01837 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
P01837 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01837 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01837 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01837 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01837 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01837 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01837 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01837 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01837 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms