Protein–RNA interactions for Protein: P01747

Ig heavy chain V region 36-65, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01747 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
P01747 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01747 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01747 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01747 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01747 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01747 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01747 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01747 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01747 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01747 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01747 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01747 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01747 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01747 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01747 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01747 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01747 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01747 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01747 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
P01747 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01747 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01747 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
P01747 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01747 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01747 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01747 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
P01747 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01747 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01747 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01747 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01747 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01747 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01747 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01747 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01747 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01747 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01747 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01747 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01747 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01747 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01747 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01747 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01747 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01747 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01747 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01747 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01747 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01747 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01747 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01747 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01747 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01747 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01747 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01747 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01747 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01747 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
P01747 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01747 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01747 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01747 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01747 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
P01747 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
P01747 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01747 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01747 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01747 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01747 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01747 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01747 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01747 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01747 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01747 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
P01747 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01747 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01747 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01747 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01747 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01747 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01747 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01747 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01747 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01747 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01747 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01747 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01747 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01747 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01747 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01747 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01747 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01747 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01747 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01747 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01747 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01747 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01747 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01747 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01747 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01747 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01747 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms