Protein–RNA interactions for Protein: P01374

LTA, Lymphotoxin-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTAP01374 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LTAP01374 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
LTAP01374 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LTAP01374 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTAP01374 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTAP01374 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTAP01374 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTAP01374 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTAP01374 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTAP01374 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTAP01374 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTAP01374 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LTAP01374 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LTAP01374 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LTAP01374 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTAP01374 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTAP01374 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTAP01374 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTAP01374 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTAP01374 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTAP01374 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTAP01374 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTAP01374 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTAP01374 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTAP01374 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTAP01374 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LTAP01374 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LTAP01374 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LTAP01374 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LTAP01374 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LTAP01374 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LTAP01374 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LTAP01374 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LTAP01374 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LTAP01374 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LTAP01374 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LTAP01374 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LTAP01374 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
LTAP01374 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LTAP01374 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LTAP01374 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LTAP01374 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LTAP01374 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LTAP01374 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LTAP01374 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LTAP01374 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTAP01374 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTAP01374 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTAP01374 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTAP01374 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTAP01374 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LTAP01374 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LTAP01374 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LTAP01374 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LTAP01374 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LTAP01374 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LTAP01374 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LTAP01374 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LTAP01374 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LTAP01374 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LTAP01374 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LTAP01374 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LTAP01374 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LTAP01374 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LTAP01374 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LTAP01374 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LTAP01374 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LTAP01374 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
LTAP01374 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LTAP01374 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LTAP01374 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LTAP01374 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LTAP01374 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LTAP01374 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
LTAP01374 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LTAP01374 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LTAP01374 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LTAP01374 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LTAP01374 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LTAP01374 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LTAP01374 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LTAP01374 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LTAP01374 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LTAP01374 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
LTAP01374 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LTAP01374 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LTAP01374 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LTAP01374 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LTAP01374 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LTAP01374 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LTAP01374 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LTAP01374 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LTAP01374 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LTAP01374 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LTAP01374 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LTAP01374 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LTAP01374 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LTAP01374 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LTAP01374 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LTAP01374 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.4 ms