Protein–RNA interactions for Protein: P01116

KRAS, GTPase KRas, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRASP01116 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRASP01116 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRASP01116 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KRASP01116 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRASP01116 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRASP01116 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRASP01116 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRASP01116 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRASP01116 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRASP01116 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRASP01116 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRASP01116 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRASP01116 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRASP01116 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRASP01116 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRASP01116 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRASP01116 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KRASP01116 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KRASP01116 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRASP01116 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRASP01116 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRASP01116 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRASP01116 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRASP01116 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRASP01116 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRASP01116 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRASP01116 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KRASP01116 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRASP01116 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRASP01116 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRASP01116 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRASP01116 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRASP01116 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRASP01116 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRASP01116 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRASP01116 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KRASP01116 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRASP01116 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRASP01116 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRASP01116 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRASP01116 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRASP01116 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRASP01116 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRASP01116 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRASP01116 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRASP01116 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRASP01116 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRASP01116 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRASP01116 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRASP01116 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRASP01116 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRASP01116 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRASP01116 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRASP01116 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRASP01116 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRASP01116 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRASP01116 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRASP01116 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRASP01116 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRASP01116 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRASP01116 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRASP01116 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRASP01116 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRASP01116 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRASP01116 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRASP01116 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRASP01116 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRASP01116 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRASP01116 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRASP01116 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRASP01116 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRASP01116 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRASP01116 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRASP01116 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRASP01116 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRASP01116 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRASP01116 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRASP01116 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRASP01116 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRASP01116 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRASP01116 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KRASP01116 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRASP01116 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRASP01116 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRASP01116 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRASP01116 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRASP01116 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRASP01116 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRASP01116 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRASP01116 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRASP01116 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRASP01116 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRASP01116 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRASP01116 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRASP01116 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRASP01116 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRASP01116 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRASP01116 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRASP01116 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRASP01116 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms