Protein–RNA interactions for Protein: P01108

Myc, Myc proto-oncogene protein, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MycP01108 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
MycP01108 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
MycP01108 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MycP01108 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MycP01108 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MycP01108 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MycP01108 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MycP01108 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MycP01108 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MycP01108 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MycP01108 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MycP01108 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MycP01108 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MycP01108 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MycP01108 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MycP01108 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MycP01108 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MycP01108 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MycP01108 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MycP01108 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MycP01108 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MycP01108 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MycP01108 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MycP01108 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MycP01108 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MycP01108 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MycP01108 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MycP01108 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
MycP01108 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MycP01108 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MycP01108 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MycP01108 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MycP01108 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
MycP01108 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MycP01108 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MycP01108 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MycP01108 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MycP01108 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MycP01108 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MycP01108 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MycP01108 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MycP01108 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MycP01108 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MycP01108 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MycP01108 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MycP01108 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MycP01108 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MycP01108 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MycP01108 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MycP01108 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MycP01108 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MycP01108 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MycP01108 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MycP01108 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MycP01108 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.57■■■□□ 2
MycP01108 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MycP01108 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MycP01108 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MycP01108 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MycP01108 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
MycP01108 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MycP01108 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MycP01108 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
MycP01108 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MycP01108 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
MycP01108 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MycP01108 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MycP01108 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MycP01108 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MycP01108 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MycP01108 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MycP01108 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MycP01108 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MycP01108 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MycP01108 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MycP01108 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MycP01108 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MycP01108 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MycP01108 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MycP01108 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MycP01108 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
MycP01108 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MycP01108 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MycP01108 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MycP01108 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MycP01108 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MycP01108 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MycP01108 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MycP01108 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MycP01108 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MycP01108 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MycP01108 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MycP01108 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MycP01108 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MycP01108 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MycP01108 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MycP01108 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MycP01108 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MycP01108 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MycP01108 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.5 ms