Protein–RNA interactions for Protein: P01036

CST4, Cystatin-S, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST4P01036 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CST4P01036 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CST4P01036 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CST4P01036 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CST4P01036 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CST4P01036 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CST4P01036 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CST4P01036 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CST4P01036 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CST4P01036 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CST4P01036 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CST4P01036 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CST4P01036 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CST4P01036 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CST4P01036 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CST4P01036 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CST4P01036 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CST4P01036 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CST4P01036 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CST4P01036 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CST4P01036 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CST4P01036 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CST4P01036 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CST4P01036 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CST4P01036 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CST4P01036 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CST4P01036 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CST4P01036 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CST4P01036 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CST4P01036 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CST4P01036 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CST4P01036 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CST4P01036 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CST4P01036 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CST4P01036 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CST4P01036 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CST4P01036 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CST4P01036 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CST4P01036 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CST4P01036 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CST4P01036 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CST4P01036 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CST4P01036 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CST4P01036 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CST4P01036 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CST4P01036 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CST4P01036 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CST4P01036 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CST4P01036 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CST4P01036 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CST4P01036 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CST4P01036 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CST4P01036 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CST4P01036 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CST4P01036 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CST4P01036 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CST4P01036 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CST4P01036 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CST4P01036 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CST4P01036 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CST4P01036 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CST4P01036 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CST4P01036 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CST4P01036 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CST4P01036 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CST4P01036 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CST4P01036 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CST4P01036 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CST4P01036 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CST4P01036 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CST4P01036 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CST4P01036 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CST4P01036 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CST4P01036 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CST4P01036 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CST4P01036 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CST4P01036 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CST4P01036 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CST4P01036 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CST4P01036 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CST4P01036 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CST4P01036 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CST4P01036 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CST4P01036 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CST4P01036 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CST4P01036 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CST4P01036 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CST4P01036 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CST4P01036 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CST4P01036 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CST4P01036 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CST4P01036 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CST4P01036 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CST4P01036 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CST4P01036 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CST4P01036 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CST4P01036 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CST4P01036 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CST4P01036 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CST4P01036 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms