Protein–RNA interactions for Protein: P00736

C1R, Complement C1r subcomponent, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1RP00736 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
C1RP00736 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
C1RP00736 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
C1RP00736 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
C1RP00736 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
C1RP00736 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
C1RP00736 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
C1RP00736 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
C1RP00736 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
C1RP00736 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
C1RP00736 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
C1RP00736 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
C1RP00736 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C1RP00736 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
C1RP00736 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
C1RP00736 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
C1RP00736 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
C1RP00736 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
C1RP00736 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
C1RP00736 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
C1RP00736 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
C1RP00736 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
C1RP00736 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
C1RP00736 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
C1RP00736 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
C1RP00736 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
C1RP00736 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
C1RP00736 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
C1RP00736 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
C1RP00736 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
C1RP00736 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
C1RP00736 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
C1RP00736 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
C1RP00736 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
C1RP00736 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
C1RP00736 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
C1RP00736 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
C1RP00736 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
C1RP00736 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
C1RP00736 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
C1RP00736 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
C1RP00736 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
C1RP00736 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
C1RP00736 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
C1RP00736 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
C1RP00736 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
C1RP00736 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
C1RP00736 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
C1RP00736 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
C1RP00736 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
C1RP00736 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
C1RP00736 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
C1RP00736 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
C1RP00736 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
C1RP00736 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
C1RP00736 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
C1RP00736 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
C1RP00736 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
C1RP00736 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
C1RP00736 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
C1RP00736 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
C1RP00736 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
C1RP00736 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
C1RP00736 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
C1RP00736 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
C1RP00736 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
C1RP00736 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
C1RP00736 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
C1RP00736 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
C1RP00736 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
C1RP00736 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
C1RP00736 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
C1RP00736 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
C1RP00736 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
C1RP00736 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
C1RP00736 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
C1RP00736 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
C1RP00736 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
C1RP00736 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
C1RP00736 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
C1RP00736 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
C1RP00736 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
C1RP00736 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
C1RP00736 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C1RP00736 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C1RP00736 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C1RP00736 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C1RP00736 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
C1RP00736 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
C1RP00736 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
C1RP00736 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
C1RP00736 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
C1RP00736 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
C1RP00736 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C1RP00736 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
C1RP00736 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
C1RP00736 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C1RP00736 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
C1RP00736 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C1RP00736 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms