Protein–RNA interactions for Protein: P00374

DHFR, Dihydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHFRP00374 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DHFRP00374 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DHFRP00374 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DHFRP00374 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DHFRP00374 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DHFRP00374 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DHFRP00374 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DHFRP00374 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DHFRP00374 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DHFRP00374 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DHFRP00374 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DHFRP00374 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DHFRP00374 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DHFRP00374 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DHFRP00374 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHFRP00374 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHFRP00374 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHFRP00374 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DHFRP00374 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DHFRP00374 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DHFRP00374 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DHFRP00374 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DHFRP00374 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DHFRP00374 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DHFRP00374 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DHFRP00374 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DHFRP00374 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DHFRP00374 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DHFRP00374 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DHFRP00374 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DHFRP00374 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DHFRP00374 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DHFRP00374 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DHFRP00374 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DHFRP00374 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DHFRP00374 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DHFRP00374 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DHFRP00374 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DHFRP00374 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DHFRP00374 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DHFRP00374 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DHFRP00374 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DHFRP00374 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DHFRP00374 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DHFRP00374 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DHFRP00374 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DHFRP00374 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DHFRP00374 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
DHFRP00374 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DHFRP00374 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DHFRP00374 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHFRP00374 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHFRP00374 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHFRP00374 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHFRP00374 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHFRP00374 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHFRP00374 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHFRP00374 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DHFRP00374 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DHFRP00374 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHFRP00374 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHFRP00374 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHFRP00374 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHFRP00374 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHFRP00374 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
DHFRP00374 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DHFRP00374 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DHFRP00374 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DHFRP00374 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DHFRP00374 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DHFRP00374 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DHFRP00374 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DHFRP00374 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DHFRP00374 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DHFRP00374 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DHFRP00374 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DHFRP00374 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DHFRP00374 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHFRP00374 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHFRP00374 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DHFRP00374 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DHFRP00374 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DHFRP00374 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DHFRP00374 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DHFRP00374 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DHFRP00374 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DHFRP00374 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DHFRP00374 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DHFRP00374 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DHFRP00374 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DHFRP00374 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DHFRP00374 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DHFRP00374 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DHFRP00374 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DHFRP00374 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DHFRP00374 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DHFRP00374 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DHFRP00374 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DHFRP00374 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DHFRP00374 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms