Protein–RNA interactions for Protein: O96017

CHEK2, Serine/threonine-protein kinase Chk2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHEK2O96017 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHEK2O96017 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHEK2O96017 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHEK2O96017 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHEK2O96017 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHEK2O96017 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHEK2O96017 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHEK2O96017 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CHEK2O96017 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHEK2O96017 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHEK2O96017 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHEK2O96017 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHEK2O96017 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHEK2O96017 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHEK2O96017 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHEK2O96017 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHEK2O96017 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHEK2O96017 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CHEK2O96017 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHEK2O96017 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHEK2O96017 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHEK2O96017 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHEK2O96017 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHEK2O96017 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHEK2O96017 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHEK2O96017 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CHEK2O96017 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHEK2O96017 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHEK2O96017 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHEK2O96017 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHEK2O96017 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHEK2O96017 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHEK2O96017 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHEK2O96017 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHEK2O96017 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHEK2O96017 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHEK2O96017 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHEK2O96017 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHEK2O96017 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHEK2O96017 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHEK2O96017 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHEK2O96017 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHEK2O96017 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CHEK2O96017 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHEK2O96017 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHEK2O96017 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHEK2O96017 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHEK2O96017 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHEK2O96017 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHEK2O96017 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHEK2O96017 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHEK2O96017 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHEK2O96017 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHEK2O96017 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHEK2O96017 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHEK2O96017 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHEK2O96017 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHEK2O96017 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHEK2O96017 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHEK2O96017 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHEK2O96017 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHEK2O96017 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHEK2O96017 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHEK2O96017 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHEK2O96017 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHEK2O96017 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHEK2O96017 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CHEK2O96017 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHEK2O96017 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHEK2O96017 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHEK2O96017 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHEK2O96017 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHEK2O96017 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHEK2O96017 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHEK2O96017 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHEK2O96017 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHEK2O96017 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CHEK2O96017 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHEK2O96017 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHEK2O96017 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHEK2O96017 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHEK2O96017 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHEK2O96017 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHEK2O96017 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHEK2O96017 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHEK2O96017 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHEK2O96017 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHEK2O96017 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHEK2O96017 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHEK2O96017 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHEK2O96017 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHEK2O96017 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHEK2O96017 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHEK2O96017 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHEK2O96017 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHEK2O96017 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHEK2O96017 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHEK2O96017 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHEK2O96017 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHEK2O96017 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.7 ms