Protein–RNA interactions for Protein: O95967

EFEMP2, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP2O95967 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EFEMP2O95967 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EFEMP2O95967 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
EFEMP2O95967 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
EFEMP2O95967 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
EFEMP2O95967 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EFEMP2O95967 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EFEMP2O95967 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
EFEMP2O95967 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
EFEMP2O95967 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EFEMP2O95967 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EFEMP2O95967 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EFEMP2O95967 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
EFEMP2O95967 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EFEMP2O95967 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EFEMP2O95967 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
EFEMP2O95967 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
EFEMP2O95967 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
EFEMP2O95967 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
EFEMP2O95967 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
EFEMP2O95967 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
EFEMP2O95967 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
EFEMP2O95967 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EFEMP2O95967 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EFEMP2O95967 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
EFEMP2O95967 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EFEMP2O95967 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EFEMP2O95967 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EFEMP2O95967 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EFEMP2O95967 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EFEMP2O95967 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EFEMP2O95967 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EFEMP2O95967 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EFEMP2O95967 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EFEMP2O95967 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EFEMP2O95967 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EFEMP2O95967 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EFEMP2O95967 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EFEMP2O95967 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EFEMP2O95967 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
EFEMP2O95967 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
EFEMP2O95967 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EFEMP2O95967 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EFEMP2O95967 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EFEMP2O95967 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EFEMP2O95967 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EFEMP2O95967 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EFEMP2O95967 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EFEMP2O95967 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
EFEMP2O95967 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
EFEMP2O95967 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
EFEMP2O95967 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
EFEMP2O95967 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
EFEMP2O95967 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
EFEMP2O95967 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
EFEMP2O95967 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
EFEMP2O95967 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
EFEMP2O95967 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
EFEMP2O95967 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
EFEMP2O95967 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
EFEMP2O95967 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
EFEMP2O95967 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
EFEMP2O95967 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EFEMP2O95967 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EFEMP2O95967 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EFEMP2O95967 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EFEMP2O95967 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EFEMP2O95967 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
EFEMP2O95967 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EFEMP2O95967 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EFEMP2O95967 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
EFEMP2O95967 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
EFEMP2O95967 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
EFEMP2O95967 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
EFEMP2O95967 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EFEMP2O95967 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EFEMP2O95967 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EFEMP2O95967 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EFEMP2O95967 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EFEMP2O95967 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EFEMP2O95967 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EFEMP2O95967 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
EFEMP2O95967 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
EFEMP2O95967 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
EFEMP2O95967 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EFEMP2O95967 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EFEMP2O95967 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EFEMP2O95967 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EFEMP2O95967 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EFEMP2O95967 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EFEMP2O95967 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EFEMP2O95967 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EFEMP2O95967 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EFEMP2O95967 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
EFEMP2O95967 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
EFEMP2O95967 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EFEMP2O95967 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EFEMP2O95967 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EFEMP2O95967 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EFEMP2O95967 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms