Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CBX6O95503 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CBX6O95503 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CBX6O95503 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CBX6O95503 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CBX6O95503 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CBX6O95503 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CBX6O95503 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CBX6O95503 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CBX6O95503 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CBX6O95503 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CBX6O95503 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CBX6O95503 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CBX6O95503 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CBX6O95503 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CBX6O95503 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CBX6O95503 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CBX6O95503 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CBX6O95503 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CBX6O95503 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CBX6O95503 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CBX6O95503 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CBX6O95503 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CBX6O95503 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CBX6O95503 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CBX6O95503 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CBX6O95503 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CBX6O95503 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CBX6O95503 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CBX6O95503 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CBX6O95503 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CBX6O95503 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CBX6O95503 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CBX6O95503 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CBX6O95503 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CBX6O95503 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CBX6O95503 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CBX6O95503 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CBX6O95503 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CBX6O95503 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CBX6O95503 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CBX6O95503 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CBX6O95503 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CBX6O95503 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CBX6O95503 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CBX6O95503 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CBX6O95503 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CBX6O95503 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CBX6O95503 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CBX6O95503 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CBX6O95503 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CBX6O95503 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CBX6O95503 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CBX6O95503 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CBX6O95503 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CBX6O95503 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CBX6O95503 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CBX6O95503 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CBX6O95503 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CBX6O95503 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CBX6O95503 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CBX6O95503 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CBX6O95503 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CBX6O95503 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CBX6O95503 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CBX6O95503 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CBX6O95503 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CBX6O95503 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CBX6O95503 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CBX6O95503 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CBX6O95503 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CBX6O95503 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CBX6O95503 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CBX6O95503 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CBX6O95503 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CBX6O95503 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CBX6O95503 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CBX6O95503 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CBX6O95503 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CBX6O95503 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CBX6O95503 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CBX6O95503 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CBX6O95503 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CBX6O95503 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CBX6O95503 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CBX6O95503 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CBX6O95503 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CBX6O95503 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CBX6O95503 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CBX6O95503 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CBX6O95503 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CBX6O95503 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CBX6O95503 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CBX6O95503 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CBX6O95503 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CBX6O95503 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CBX6O95503 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CBX6O95503 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CBX6O95503 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CBX6O95503 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms