Protein–RNA interactions for Protein: O95263

PDE8B, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, humanhuman

Predictions only

Length 885 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8BO95263 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PDE8BO95263 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PDE8BO95263 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PDE8BO95263 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
PDE8BO95263 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PDE8BO95263 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PDE8BO95263 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PDE8BO95263 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PDE8BO95263 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PDE8BO95263 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PDE8BO95263 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PDE8BO95263 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PDE8BO95263 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PDE8BO95263 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PDE8BO95263 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PDE8BO95263 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PDE8BO95263 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PDE8BO95263 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PDE8BO95263 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PDE8BO95263 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PDE8BO95263 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PDE8BO95263 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PDE8BO95263 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PDE8BO95263 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PDE8BO95263 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PDE8BO95263 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PDE8BO95263 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PDE8BO95263 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PDE8BO95263 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PDE8BO95263 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PDE8BO95263 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PDE8BO95263 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PDE8BO95263 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PDE8BO95263 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PDE8BO95263 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PDE8BO95263 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
PDE8BO95263 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
PDE8BO95263 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
PDE8BO95263 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PDE8BO95263 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
PDE8BO95263 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PDE8BO95263 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PDE8BO95263 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PDE8BO95263 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PDE8BO95263 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
PDE8BO95263 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PDE8BO95263 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PDE8BO95263 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PDE8BO95263 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PDE8BO95263 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PDE8BO95263 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PDE8BO95263 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PDE8BO95263 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PDE8BO95263 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PDE8BO95263 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PDE8BO95263 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PDE8BO95263 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PDE8BO95263 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PDE8BO95263 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
PDE8BO95263 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
PDE8BO95263 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PDE8BO95263 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PDE8BO95263 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PDE8BO95263 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PDE8BO95263 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PDE8BO95263 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PDE8BO95263 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
PDE8BO95263 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PDE8BO95263 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PDE8BO95263 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PDE8BO95263 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PDE8BO95263 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PDE8BO95263 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PDE8BO95263 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PDE8BO95263 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PDE8BO95263 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PDE8BO95263 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PDE8BO95263 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PDE8BO95263 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PDE8BO95263 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PDE8BO95263 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PDE8BO95263 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PDE8BO95263 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PDE8BO95263 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PDE8BO95263 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PDE8BO95263 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PDE8BO95263 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PDE8BO95263 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PDE8BO95263 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PDE8BO95263 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PDE8BO95263 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PDE8BO95263 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PDE8BO95263 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PDE8BO95263 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PDE8BO95263 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PDE8BO95263 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PDE8BO95263 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PDE8BO95263 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PDE8BO95263 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PDE8BO95263 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms