Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG12O94817 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG12O94817 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG12O94817 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG12O94817 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG12O94817 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG12O94817 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG12O94817 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG12O94817 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG12O94817 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG12O94817 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG12O94817 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG12O94817 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG12O94817 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG12O94817 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATG12O94817 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATG12O94817 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATG12O94817 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG12O94817 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG12O94817 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG12O94817 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG12O94817 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG12O94817 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG12O94817 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG12O94817 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG12O94817 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG12O94817 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG12O94817 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG12O94817 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG12O94817 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ATG12O94817 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG12O94817 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG12O94817 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG12O94817 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG12O94817 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG12O94817 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG12O94817 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG12O94817 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG12O94817 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG12O94817 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG12O94817 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG12O94817 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG12O94817 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG12O94817 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG12O94817 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG12O94817 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG12O94817 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG12O94817 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG12O94817 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG12O94817 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG12O94817 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATG12O94817 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG12O94817 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG12O94817 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG12O94817 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG12O94817 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG12O94817 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG12O94817 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG12O94817 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG12O94817 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG12O94817 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG12O94817 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG12O94817 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG12O94817 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG12O94817 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG12O94817 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG12O94817 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG12O94817 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG12O94817 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG12O94817 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG12O94817 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG12O94817 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATG12O94817 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATG12O94817 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG12O94817 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG12O94817 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG12O94817 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG12O94817 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG12O94817 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG12O94817 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG12O94817 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG12O94817 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG12O94817 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG12O94817 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG12O94817 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG12O94817 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG12O94817 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG12O94817 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG12O94817 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG12O94817 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG12O94817 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG12O94817 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG12O94817 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG12O94817 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG12O94817 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG12O94817 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG12O94817 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG12O94817 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG12O94817 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG12O94817 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms