Protein–RNA interactions for Protein: O94779

CNTN5, Contactin-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN5O94779 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CNTN5O94779 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CNTN5O94779 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CNTN5O94779 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CNTN5O94779 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CNTN5O94779 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CNTN5O94779 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CNTN5O94779 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
CNTN5O94779 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNTN5O94779 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNTN5O94779 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CNTN5O94779 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNTN5O94779 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNTN5O94779 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNTN5O94779 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNTN5O94779 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNTN5O94779 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CNTN5O94779 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNTN5O94779 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNTN5O94779 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNTN5O94779 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNTN5O94779 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNTN5O94779 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CNTN5O94779 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNTN5O94779 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNTN5O94779 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNTN5O94779 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNTN5O94779 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNTN5O94779 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNTN5O94779 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNTN5O94779 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNTN5O94779 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNTN5O94779 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNTN5O94779 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNTN5O94779 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CNTN5O94779 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CNTN5O94779 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CNTN5O94779 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CNTN5O94779 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
CNTN5O94779 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNTN5O94779 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNTN5O94779 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNTN5O94779 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNTN5O94779 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNTN5O94779 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNTN5O94779 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNTN5O94779 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNTN5O94779 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNTN5O94779 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNTN5O94779 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNTN5O94779 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNTN5O94779 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNTN5O94779 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNTN5O94779 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNTN5O94779 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CNTN5O94779 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CNTN5O94779 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CNTN5O94779 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTN5O94779 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTN5O94779 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTN5O94779 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNTN5O94779 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNTN5O94779 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNTN5O94779 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNTN5O94779 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNTN5O94779 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNTN5O94779 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNTN5O94779 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNTN5O94779 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNTN5O94779 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNTN5O94779 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNTN5O94779 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNTN5O94779 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNTN5O94779 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNTN5O94779 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNTN5O94779 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNTN5O94779 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNTN5O94779 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNTN5O94779 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNTN5O94779 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNTN5O94779 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNTN5O94779 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNTN5O94779 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNTN5O94779 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNTN5O94779 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNTN5O94779 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNTN5O94779 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNTN5O94779 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNTN5O94779 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CNTN5O94779 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNTN5O94779 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNTN5O94779 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNTN5O94779 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNTN5O94779 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNTN5O94779 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CNTN5O94779 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNTN5O94779 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNTN5O94779 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNTN5O94779 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNTN5O94779 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms