Protein–RNA interactions for Protein: O88447

Klc1, Kinesin light chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc1O88447 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Klc1O88447 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Klc1O88447 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Klc1O88447 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Klc1O88447 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Klc1O88447 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Klc1O88447 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Klc1O88447 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Klc1O88447 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Klc1O88447 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Klc1O88447 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Klc1O88447 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Klc1O88447 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Klc1O88447 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Klc1O88447 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Klc1O88447 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Klc1O88447 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Klc1O88447 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Klc1O88447 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Klc1O88447 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Klc1O88447 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Klc1O88447 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Klc1O88447 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Klc1O88447 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Klc1O88447 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Klc1O88447 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Klc1O88447 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Klc1O88447 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Klc1O88447 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Klc1O88447 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Klc1O88447 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Klc1O88447 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Klc1O88447 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Klc1O88447 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Klc1O88447 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Klc1O88447 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Klc1O88447 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Klc1O88447 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Klc1O88447 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Klc1O88447 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Klc1O88447 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Klc1O88447 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Klc1O88447 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Klc1O88447 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Klc1O88447 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Klc1O88447 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Klc1O88447 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Klc1O88447 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Klc1O88447 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Klc1O88447 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Klc1O88447 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Klc1O88447 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Klc1O88447 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Klc1O88447 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Klc1O88447 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Klc1O88447 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Klc1O88447 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Klc1O88447 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Klc1O88447 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Klc1O88447 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Klc1O88447 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Klc1O88447 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Klc1O88447 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Klc1O88447 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Klc1O88447 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Klc1O88447 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Klc1O88447 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Klc1O88447 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Klc1O88447 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Klc1O88447 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Klc1O88447 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Klc1O88447 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Klc1O88447 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Klc1O88447 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Klc1O88447 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Klc1O88447 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Klc1O88447 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Klc1O88447 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Klc1O88447 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Klc1O88447 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Klc1O88447 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Klc1O88447 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Klc1O88447 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Klc1O88447 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Klc1O88447 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Klc1O88447 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Klc1O88447 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Klc1O88447 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Klc1O88447 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Klc1O88447 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Klc1O88447 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Klc1O88447 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Klc1O88447 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Klc1O88447 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Klc1O88447 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Klc1O88447 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Klc1O88447 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Klc1O88447 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Klc1O88447 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Klc1O88447 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms