Protein–RNA interactions for Protein: O76011

KRT34, Keratin, type I cuticular Ha4, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT34O76011 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT34O76011 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT34O76011 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT34O76011 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT34O76011 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT34O76011 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT34O76011 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT34O76011 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT34O76011 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT34O76011 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT34O76011 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT34O76011 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT34O76011 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT34O76011 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
KRT34O76011 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT34O76011 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT34O76011 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT34O76011 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT34O76011 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT34O76011 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT34O76011 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT34O76011 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT34O76011 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT34O76011 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT34O76011 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT34O76011 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT34O76011 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT34O76011 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT34O76011 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KRT34O76011 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT34O76011 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT34O76011 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT34O76011 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT34O76011 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT34O76011 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT34O76011 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT34O76011 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT34O76011 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT34O76011 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT34O76011 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT34O76011 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT34O76011 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT34O76011 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT34O76011 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT34O76011 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT34O76011 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KRT34O76011 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KRT34O76011 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT34O76011 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT34O76011 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT34O76011 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT34O76011 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT34O76011 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT34O76011 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT34O76011 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT34O76011 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT34O76011 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT34O76011 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KRT34O76011 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KRT34O76011 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT34O76011 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT34O76011 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT34O76011 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT34O76011 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT34O76011 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT34O76011 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT34O76011 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT34O76011 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT34O76011 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT34O76011 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT34O76011 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT34O76011 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT34O76011 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT34O76011 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT34O76011 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT34O76011 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT34O76011 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT34O76011 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT34O76011 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT34O76011 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT34O76011 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT34O76011 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT34O76011 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT34O76011 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT34O76011 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT34O76011 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT34O76011 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KRT34O76011 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT34O76011 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT34O76011 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT34O76011 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT34O76011 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT34O76011 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT34O76011 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT34O76011 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT34O76011 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT34O76011 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT34O76011 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT34O76011 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT34O76011 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms