Protein–RNA interactions for Protein: O75752

B3GALNT1, UDP-GalNAc:beta-1,3-N-acetylgalactosaminyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3GALNT1O75752 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
B3GALNT1O75752 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
B3GALNT1O75752 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
B3GALNT1O75752 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
B3GALNT1O75752 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
B3GALNT1O75752 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
B3GALNT1O75752 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
B3GALNT1O75752 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
B3GALNT1O75752 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
B3GALNT1O75752 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
B3GALNT1O75752 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
B3GALNT1O75752 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
B3GALNT1O75752 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
B3GALNT1O75752 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
B3GALNT1O75752 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
B3GALNT1O75752 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
B3GALNT1O75752 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
B3GALNT1O75752 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
B3GALNT1O75752 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
B3GALNT1O75752 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
B3GALNT1O75752 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
B3GALNT1O75752 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
B3GALNT1O75752 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
B3GALNT1O75752 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
B3GALNT1O75752 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
B3GALNT1O75752 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
B3GALNT1O75752 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
B3GALNT1O75752 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
B3GALNT1O75752 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
B3GALNT1O75752 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
B3GALNT1O75752 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
B3GALNT1O75752 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
B3GALNT1O75752 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
B3GALNT1O75752 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
B3GALNT1O75752 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
B3GALNT1O75752 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
B3GALNT1O75752 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
B3GALNT1O75752 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
B3GALNT1O75752 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
B3GALNT1O75752 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
B3GALNT1O75752 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
B3GALNT1O75752 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
B3GALNT1O75752 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
B3GALNT1O75752 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
B3GALNT1O75752 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
B3GALNT1O75752 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
B3GALNT1O75752 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
B3GALNT1O75752 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
B3GALNT1O75752 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
B3GALNT1O75752 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
B3GALNT1O75752 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
B3GALNT1O75752 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
B3GALNT1O75752 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
B3GALNT1O75752 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
B3GALNT1O75752 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
B3GALNT1O75752 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
B3GALNT1O75752 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
B3GALNT1O75752 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
B3GALNT1O75752 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
B3GALNT1O75752 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
B3GALNT1O75752 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
B3GALNT1O75752 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
B3GALNT1O75752 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
B3GALNT1O75752 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
B3GALNT1O75752 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
B3GALNT1O75752 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
B3GALNT1O75752 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
B3GALNT1O75752 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
B3GALNT1O75752 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
B3GALNT1O75752 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
B3GALNT1O75752 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
B3GALNT1O75752 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
B3GALNT1O75752 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
B3GALNT1O75752 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
B3GALNT1O75752 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
B3GALNT1O75752 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
B3GALNT1O75752 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
B3GALNT1O75752 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
B3GALNT1O75752 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
B3GALNT1O75752 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
B3GALNT1O75752 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
B3GALNT1O75752 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
B3GALNT1O75752 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
B3GALNT1O75752 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
B3GALNT1O75752 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
B3GALNT1O75752 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
B3GALNT1O75752 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
B3GALNT1O75752 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
B3GALNT1O75752 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
B3GALNT1O75752 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
B3GALNT1O75752 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
B3GALNT1O75752 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
B3GALNT1O75752 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
B3GALNT1O75752 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
B3GALNT1O75752 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
B3GALNT1O75752 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
B3GALNT1O75752 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
B3GALNT1O75752 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
B3GALNT1O75752 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
B3GALNT1O75752 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms