Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLDN11O75508 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLDN11O75508 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLDN11O75508 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLDN11O75508 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLDN11O75508 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLDN11O75508 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLDN11O75508 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLDN11O75508 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLDN11O75508 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CLDN11O75508 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLDN11O75508 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLDN11O75508 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLDN11O75508 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLDN11O75508 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLDN11O75508 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLDN11O75508 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLDN11O75508 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CLDN11O75508 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLDN11O75508 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLDN11O75508 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLDN11O75508 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLDN11O75508 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLDN11O75508 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLDN11O75508 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLDN11O75508 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLDN11O75508 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLDN11O75508 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLDN11O75508 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLDN11O75508 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CLDN11O75508 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLDN11O75508 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLDN11O75508 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLDN11O75508 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLDN11O75508 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLDN11O75508 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLDN11O75508 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLDN11O75508 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLDN11O75508 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLDN11O75508 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLDN11O75508 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CLDN11O75508 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLDN11O75508 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLDN11O75508 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLDN11O75508 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLDN11O75508 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLDN11O75508 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLDN11O75508 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLDN11O75508 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLDN11O75508 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLDN11O75508 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLDN11O75508 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLDN11O75508 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLDN11O75508 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLDN11O75508 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLDN11O75508 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLDN11O75508 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLDN11O75508 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLDN11O75508 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLDN11O75508 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLDN11O75508 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLDN11O75508 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLDN11O75508 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLDN11O75508 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CLDN11O75508 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLDN11O75508 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLDN11O75508 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLDN11O75508 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLDN11O75508 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLDN11O75508 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLDN11O75508 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLDN11O75508 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLDN11O75508 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLDN11O75508 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLDN11O75508 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CLDN11O75508 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLDN11O75508 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLDN11O75508 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLDN11O75508 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLDN11O75508 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLDN11O75508 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLDN11O75508 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLDN11O75508 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLDN11O75508 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLDN11O75508 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLDN11O75508 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLDN11O75508 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLDN11O75508 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLDN11O75508 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLDN11O75508 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLDN11O75508 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLDN11O75508 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLDN11O75508 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLDN11O75508 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLDN11O75508 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CLDN11O75508 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CLDN11O75508 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLDN11O75508 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLDN11O75508 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLDN11O75508 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms