Protein–RNA interactions for Protein: O75317

USP12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP12O75317 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP12O75317 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
USP12O75317 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP12O75317 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP12O75317 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP12O75317 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP12O75317 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP12O75317 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP12O75317 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP12O75317 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP12O75317 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP12O75317 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP12O75317 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP12O75317 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP12O75317 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP12O75317 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP12O75317 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP12O75317 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP12O75317 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP12O75317 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP12O75317 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP12O75317 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
USP12O75317 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP12O75317 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP12O75317 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP12O75317 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP12O75317 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP12O75317 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP12O75317 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP12O75317 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP12O75317 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP12O75317 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP12O75317 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP12O75317 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP12O75317 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP12O75317 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP12O75317 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP12O75317 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP12O75317 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP12O75317 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
USP12O75317 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP12O75317 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP12O75317 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
USP12O75317 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
USP12O75317 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP12O75317 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP12O75317 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP12O75317 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP12O75317 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP12O75317 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
USP12O75317 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
USP12O75317 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP12O75317 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP12O75317 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP12O75317 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP12O75317 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP12O75317 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP12O75317 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP12O75317 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP12O75317 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP12O75317 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP12O75317 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
USP12O75317 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP12O75317 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
USP12O75317 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP12O75317 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP12O75317 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
USP12O75317 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
USP12O75317 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP12O75317 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP12O75317 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP12O75317 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP12O75317 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP12O75317 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP12O75317 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP12O75317 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP12O75317 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP12O75317 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP12O75317 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP12O75317 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP12O75317 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP12O75317 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP12O75317 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP12O75317 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
USP12O75317 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP12O75317 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP12O75317 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
USP12O75317 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP12O75317 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP12O75317 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP12O75317 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP12O75317 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP12O75317 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP12O75317 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP12O75317 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP12O75317 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP12O75317 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP12O75317 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP12O75317 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP12O75317 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms