Protein–RNA interactions for Protein: O75208

COQ9, Ubiquinone biosynthesis protein COQ9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COQ9O75208 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COQ9O75208 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COQ9O75208 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COQ9O75208 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
COQ9O75208 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COQ9O75208 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COQ9O75208 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COQ9O75208 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COQ9O75208 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
COQ9O75208 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COQ9O75208 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COQ9O75208 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COQ9O75208 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COQ9O75208 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COQ9O75208 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COQ9O75208 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COQ9O75208 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COQ9O75208 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COQ9O75208 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COQ9O75208 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COQ9O75208 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
COQ9O75208 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COQ9O75208 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COQ9O75208 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COQ9O75208 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COQ9O75208 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COQ9O75208 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COQ9O75208 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COQ9O75208 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
COQ9O75208 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COQ9O75208 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COQ9O75208 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COQ9O75208 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COQ9O75208 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COQ9O75208 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COQ9O75208 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COQ9O75208 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COQ9O75208 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COQ9O75208 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COQ9O75208 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COQ9O75208 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COQ9O75208 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COQ9O75208 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
COQ9O75208 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
COQ9O75208 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COQ9O75208 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COQ9O75208 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COQ9O75208 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COQ9O75208 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
COQ9O75208 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COQ9O75208 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COQ9O75208 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COQ9O75208 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COQ9O75208 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COQ9O75208 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COQ9O75208 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COQ9O75208 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COQ9O75208 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COQ9O75208 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COQ9O75208 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COQ9O75208 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COQ9O75208 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COQ9O75208 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COQ9O75208 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COQ9O75208 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COQ9O75208 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COQ9O75208 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COQ9O75208 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COQ9O75208 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COQ9O75208 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COQ9O75208 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COQ9O75208 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COQ9O75208 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COQ9O75208 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COQ9O75208 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COQ9O75208 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COQ9O75208 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COQ9O75208 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COQ9O75208 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COQ9O75208 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COQ9O75208 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COQ9O75208 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COQ9O75208 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COQ9O75208 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COQ9O75208 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COQ9O75208 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COQ9O75208 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COQ9O75208 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COQ9O75208 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COQ9O75208 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COQ9O75208 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COQ9O75208 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COQ9O75208 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COQ9O75208 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COQ9O75208 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
COQ9O75208 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COQ9O75208 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COQ9O75208 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COQ9O75208 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COQ9O75208 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms