Protein–RNA interactions for Protein: O75074

LRP3, Low-density lipoprotein receptor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP3O75074 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRP3O75074 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRP3O75074 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRP3O75074 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRP3O75074 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRP3O75074 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRP3O75074 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRP3O75074 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRP3O75074 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRP3O75074 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRP3O75074 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
LRP3O75074 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRP3O75074 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRP3O75074 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRP3O75074 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRP3O75074 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRP3O75074 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRP3O75074 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRP3O75074 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRP3O75074 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRP3O75074 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRP3O75074 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRP3O75074 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRP3O75074 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LRP3O75074 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LRP3O75074 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRP3O75074 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRP3O75074 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRP3O75074 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRP3O75074 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRP3O75074 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRP3O75074 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRP3O75074 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRP3O75074 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRP3O75074 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRP3O75074 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
LRP3O75074 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
LRP3O75074 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRP3O75074 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRP3O75074 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRP3O75074 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRP3O75074 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRP3O75074 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRP3O75074 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRP3O75074 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LRP3O75074 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LRP3O75074 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LRP3O75074 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LRP3O75074 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRP3O75074 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LRP3O75074 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LRP3O75074 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LRP3O75074 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LRP3O75074 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LRP3O75074 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRP3O75074 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRP3O75074 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRP3O75074 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRP3O75074 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRP3O75074 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRP3O75074 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRP3O75074 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRP3O75074 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRP3O75074 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRP3O75074 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRP3O75074 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRP3O75074 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRP3O75074 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRP3O75074 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRP3O75074 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRP3O75074 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRP3O75074 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRP3O75074 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRP3O75074 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRP3O75074 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRP3O75074 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRP3O75074 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRP3O75074 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRP3O75074 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRP3O75074 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRP3O75074 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRP3O75074 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRP3O75074 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRP3O75074 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRP3O75074 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRP3O75074 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRP3O75074 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRP3O75074 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRP3O75074 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRP3O75074 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
LRP3O75074 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRP3O75074 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRP3O75074 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRP3O75074 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRP3O75074 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRP3O75074 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRP3O75074 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRP3O75074 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRP3O75074 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRP3O75074 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms