Protein–RNA interactions for Protein: O60393

NOBOX, Homeobox protein NOBOX, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOBOXO60393 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NOBOXO60393 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NOBOXO60393 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
NOBOXO60393 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
NOBOXO60393 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NOBOXO60393 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NOBOXO60393 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NOBOXO60393 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NOBOXO60393 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NOBOXO60393 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NOBOXO60393 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NOBOXO60393 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NOBOXO60393 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NOBOXO60393 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NOBOXO60393 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NOBOXO60393 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NOBOXO60393 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NOBOXO60393 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NOBOXO60393 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NOBOXO60393 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NOBOXO60393 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NOBOXO60393 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NOBOXO60393 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NOBOXO60393 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NOBOXO60393 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NOBOXO60393 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NOBOXO60393 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NOBOXO60393 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NOBOXO60393 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NOBOXO60393 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NOBOXO60393 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NOBOXO60393 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NOBOXO60393 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NOBOXO60393 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NOBOXO60393 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NOBOXO60393 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NOBOXO60393 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NOBOXO60393 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NOBOXO60393 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NOBOXO60393 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NOBOXO60393 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NOBOXO60393 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NOBOXO60393 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NOBOXO60393 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NOBOXO60393 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NOBOXO60393 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NOBOXO60393 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NOBOXO60393 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NOBOXO60393 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NOBOXO60393 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NOBOXO60393 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NOBOXO60393 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NOBOXO60393 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NOBOXO60393 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NOBOXO60393 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NOBOXO60393 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NOBOXO60393 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NOBOXO60393 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NOBOXO60393 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NOBOXO60393 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NOBOXO60393 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NOBOXO60393 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NOBOXO60393 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NOBOXO60393 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NOBOXO60393 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
NOBOXO60393 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NOBOXO60393 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NOBOXO60393 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NOBOXO60393 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NOBOXO60393 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NOBOXO60393 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NOBOXO60393 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NOBOXO60393 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NOBOXO60393 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NOBOXO60393 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NOBOXO60393 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NOBOXO60393 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NOBOXO60393 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NOBOXO60393 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NOBOXO60393 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NOBOXO60393 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NOBOXO60393 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NOBOXO60393 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NOBOXO60393 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NOBOXO60393 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NOBOXO60393 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NOBOXO60393 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NOBOXO60393 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NOBOXO60393 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NOBOXO60393 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NOBOXO60393 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NOBOXO60393 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOBOXO60393 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOBOXO60393 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOBOXO60393 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOBOXO60393 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOBOXO60393 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NOBOXO60393 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NOBOXO60393 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NOBOXO60393 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms