Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nipsnap1O55125 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nipsnap1O55125 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nipsnap1O55125 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nipsnap1O55125 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nipsnap1O55125 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nipsnap1O55125 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nipsnap1O55125 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nipsnap1O55125 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nipsnap1O55125 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nipsnap1O55125 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nipsnap1O55125 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nipsnap1O55125 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nipsnap1O55125 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nipsnap1O55125 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nipsnap1O55125 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Nipsnap1O55125 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nipsnap1O55125 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nipsnap1O55125 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nipsnap1O55125 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nipsnap1O55125 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nipsnap1O55125 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nipsnap1O55125 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nipsnap1O55125 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nipsnap1O55125 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nipsnap1O55125 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Nipsnap1O55125 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Nipsnap1O55125 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nipsnap1O55125 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nipsnap1O55125 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nipsnap1O55125 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nipsnap1O55125 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nipsnap1O55125 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nipsnap1O55125 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nipsnap1O55125 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Nipsnap1O55125 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nipsnap1O55125 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nipsnap1O55125 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nipsnap1O55125 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nipsnap1O55125 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nipsnap1O55125 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nipsnap1O55125 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Nipsnap1O55125 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nipsnap1O55125 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nipsnap1O55125 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nipsnap1O55125 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nipsnap1O55125 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Nipsnap1O55125 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nipsnap1O55125 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nipsnap1O55125 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nipsnap1O55125 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nipsnap1O55125 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nipsnap1O55125 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nipsnap1O55125 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nipsnap1O55125 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nipsnap1O55125 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nipsnap1O55125 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nipsnap1O55125 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nipsnap1O55125 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nipsnap1O55125 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nipsnap1O55125 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nipsnap1O55125 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nipsnap1O55125 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nipsnap1O55125 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nipsnap1O55125 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nipsnap1O55125 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nipsnap1O55125 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nipsnap1O55125 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nipsnap1O55125 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nipsnap1O55125 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nipsnap1O55125 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nipsnap1O55125 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nipsnap1O55125 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nipsnap1O55125 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nipsnap1O55125 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nipsnap1O55125 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nipsnap1O55125 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Nipsnap1O55125 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nipsnap1O55125 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nipsnap1O55125 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nipsnap1O55125 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nipsnap1O55125 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nipsnap1O55125 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nipsnap1O55125 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nipsnap1O55125 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nipsnap1O55125 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nipsnap1O55125 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nipsnap1O55125 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nipsnap1O55125 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nipsnap1O55125 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nipsnap1O55125 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nipsnap1O55125 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nipsnap1O55125 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nipsnap1O55125 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nipsnap1O55125 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nipsnap1O55125 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nipsnap1O55125 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nipsnap1O55125 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nipsnap1O55125 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nipsnap1O55125 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms