Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Syngr2O55101 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Syngr2O55101 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Syngr2O55101 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Syngr2O55101 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Syngr2O55101 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Syngr2O55101 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Syngr2O55101 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Syngr2O55101 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Syngr2O55101 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Syngr2O55101 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Syngr2O55101 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Syngr2O55101 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Syngr2O55101 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Syngr2O55101 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Syngr2O55101 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Syngr2O55101 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Syngr2O55101 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Syngr2O55101 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syngr2O55101 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syngr2O55101 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syngr2O55101 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syngr2O55101 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syngr2O55101 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syngr2O55101 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syngr2O55101 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Syngr2O55101 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syngr2O55101 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Syngr2O55101 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Syngr2O55101 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Syngr2O55101 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Syngr2O55101 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syngr2O55101 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Syngr2O55101 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syngr2O55101 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syngr2O55101 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syngr2O55101 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Syngr2O55101 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syngr2O55101 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syngr2O55101 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syngr2O55101 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syngr2O55101 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Syngr2O55101 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syngr2O55101 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syngr2O55101 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syngr2O55101 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syngr2O55101 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syngr2O55101 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syngr2O55101 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syngr2O55101 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syngr2O55101 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Syngr2O55101 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syngr2O55101 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syngr2O55101 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syngr2O55101 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syngr2O55101 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syngr2O55101 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syngr2O55101 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Syngr2O55101 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syngr2O55101 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syngr2O55101 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syngr2O55101 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syngr2O55101 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syngr2O55101 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syngr2O55101 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syngr2O55101 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Syngr2O55101 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syngr2O55101 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syngr2O55101 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syngr2O55101 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syngr2O55101 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syngr2O55101 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syngr2O55101 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syngr2O55101 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syngr2O55101 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syngr2O55101 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syngr2O55101 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syngr2O55101 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syngr2O55101 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syngr2O55101 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syngr2O55101 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syngr2O55101 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syngr2O55101 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syngr2O55101 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syngr2O55101 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syngr2O55101 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Syngr2O55101 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Syngr2O55101 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Syngr2O55101 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Syngr2O55101 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Syngr2O55101 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Syngr2O55101 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Syngr2O55101 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Syngr2O55101 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Syngr2O55101 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Syngr2O55101 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Syngr2O55101 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Syngr2O55101 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syngr2O55101 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syngr2O55101 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms