Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Copb2O55029 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Copb2O55029 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Copb2O55029 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Copb2O55029 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Copb2O55029 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Copb2O55029 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Copb2O55029 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Copb2O55029 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Copb2O55029 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Copb2O55029 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Copb2O55029 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Copb2O55029 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Copb2O55029 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Copb2O55029 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Copb2O55029 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Copb2O55029 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Copb2O55029 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Copb2O55029 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Copb2O55029 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Copb2O55029 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Copb2O55029 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Copb2O55029 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Copb2O55029 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Copb2O55029 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Copb2O55029 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Copb2O55029 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Copb2O55029 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Copb2O55029 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Copb2O55029 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Copb2O55029 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Copb2O55029 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Copb2O55029 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Copb2O55029 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Copb2O55029 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Copb2O55029 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Copb2O55029 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Copb2O55029 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Copb2O55029 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Copb2O55029 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Copb2O55029 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Copb2O55029 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Copb2O55029 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Copb2O55029 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Copb2O55029 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Copb2O55029 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Copb2O55029 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Copb2O55029 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Copb2O55029 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Copb2O55029 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Copb2O55029 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Copb2O55029 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Copb2O55029 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Copb2O55029 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Copb2O55029 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Copb2O55029 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Copb2O55029 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Copb2O55029 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Copb2O55029 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Copb2O55029 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Copb2O55029 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Copb2O55029 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Copb2O55029 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Copb2O55029 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Copb2O55029 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Copb2O55029 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Copb2O55029 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Copb2O55029 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Copb2O55029 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Copb2O55029 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Copb2O55029 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Copb2O55029 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Copb2O55029 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Copb2O55029 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Copb2O55029 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Copb2O55029 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Copb2O55029 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Copb2O55029 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Copb2O55029 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Copb2O55029 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Copb2O55029 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Copb2O55029 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Copb2O55029 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Copb2O55029 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Copb2O55029 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Copb2O55029 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Copb2O55029 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Copb2O55029 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Copb2O55029 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Copb2O55029 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Copb2O55029 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Copb2O55029 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Copb2O55029 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Copb2O55029 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Copb2O55029 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Copb2O55029 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Copb2O55029 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Copb2O55029 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Copb2O55029 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Copb2O55029 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms