Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tnk2O54967 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tnk2O54967 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Tnk2O54967 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tnk2O54967 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Tnk2O54967 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnk2O54967 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnk2O54967 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tnk2O54967 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tnk2O54967 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tnk2O54967 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tnk2O54967 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tnk2O54967 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tnk2O54967 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tnk2O54967 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnk2O54967 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnk2O54967 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tnk2O54967 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Tnk2O54967 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnk2O54967 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tnk2O54967 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tnk2O54967 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tnk2O54967 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tnk2O54967 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tnk2O54967 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnk2O54967 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnk2O54967 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tnk2O54967 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tnk2O54967 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tnk2O54967 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnk2O54967 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tnk2O54967 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Tnk2O54967 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tnk2O54967 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tnk2O54967 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnk2O54967 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tnk2O54967 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tnk2O54967 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Tnk2O54967 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnk2O54967 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tnk2O54967 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tnk2O54967 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tnk2O54967 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tnk2O54967 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tnk2O54967 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnk2O54967 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnk2O54967 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnk2O54967 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnk2O54967 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tnk2O54967 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnk2O54967 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnk2O54967 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tnk2O54967 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tnk2O54967 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tnk2O54967 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tnk2O54967 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tnk2O54967 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tnk2O54967 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnk2O54967 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnk2O54967 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnk2O54967 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnk2O54967 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnk2O54967 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnk2O54967 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tnk2O54967 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Tnk2O54967 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tnk2O54967 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Tnk2O54967 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tnk2O54967 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnk2O54967 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnk2O54967 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnk2O54967 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tnk2O54967 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tnk2O54967 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tnk2O54967 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tnk2O54967 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tnk2O54967 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tnk2O54967 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Tnk2O54967 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnk2O54967 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnk2O54967 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnk2O54967 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnk2O54967 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnk2O54967 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnk2O54967 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnk2O54967 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnk2O54967 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnk2O54967 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnk2O54967 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnk2O54967 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnk2O54967 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnk2O54967 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnk2O54967 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnk2O54967 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tnk2O54967 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Tnk2O54967 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnk2O54967 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnk2O54967 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tnk2O54967 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Tnk2O54967 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms