Protein–RNA interactions for Protein: O54962

Banf1, Barrier-to-autointegration factor, mousemouse

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Banf1O54962 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Banf1O54962 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Banf1O54962 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Banf1O54962 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Banf1O54962 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Banf1O54962 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Banf1O54962 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Banf1O54962 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Banf1O54962 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Banf1O54962 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Banf1O54962 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Banf1O54962 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Banf1O54962 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Banf1O54962 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Banf1O54962 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Banf1O54962 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Banf1O54962 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Banf1O54962 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Banf1O54962 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Banf1O54962 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Banf1O54962 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Banf1O54962 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Banf1O54962 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Banf1O54962 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Banf1O54962 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Banf1O54962 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Banf1O54962 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Banf1O54962 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Banf1O54962 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Banf1O54962 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Banf1O54962 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Banf1O54962 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Banf1O54962 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Banf1O54962 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Banf1O54962 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Banf1O54962 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Banf1O54962 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Banf1O54962 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Banf1O54962 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Banf1O54962 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Banf1O54962 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Banf1O54962 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Banf1O54962 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Banf1O54962 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Banf1O54962 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Banf1O54962 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Banf1O54962 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Banf1O54962 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Banf1O54962 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Banf1O54962 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Banf1O54962 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Banf1O54962 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Banf1O54962 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Banf1O54962 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Banf1O54962 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Banf1O54962 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Banf1O54962 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Banf1O54962 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Banf1O54962 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Banf1O54962 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Banf1O54962 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Banf1O54962 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Banf1O54962 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Banf1O54962 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Banf1O54962 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Banf1O54962 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Banf1O54962 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Banf1O54962 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Banf1O54962 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Banf1O54962 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Banf1O54962 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Banf1O54962 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Banf1O54962 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Banf1O54962 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Banf1O54962 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Banf1O54962 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Banf1O54962 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Banf1O54962 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Banf1O54962 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Banf1O54962 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Banf1O54962 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Banf1O54962 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Banf1O54962 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Banf1O54962 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Banf1O54962 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Banf1O54962 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Banf1O54962 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Banf1O54962 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Banf1O54962 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Banf1O54962 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Banf1O54962 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Banf1O54962 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Banf1O54962 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Banf1O54962 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Banf1O54962 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Banf1O54962 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Banf1O54962 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Banf1O54962 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Banf1O54962 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Banf1O54962 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms