Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CrxO54751 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CrxO54751 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CrxO54751 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CrxO54751 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CrxO54751 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CrxO54751 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CrxO54751 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CrxO54751 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CrxO54751 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CrxO54751 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CrxO54751 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CrxO54751 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CrxO54751 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CrxO54751 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CrxO54751 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CrxO54751 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CrxO54751 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CrxO54751 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CrxO54751 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CrxO54751 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CrxO54751 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CrxO54751 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CrxO54751 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CrxO54751 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CrxO54751 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CrxO54751 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CrxO54751 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CrxO54751 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CrxO54751 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CrxO54751 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CrxO54751 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CrxO54751 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CrxO54751 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CrxO54751 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CrxO54751 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CrxO54751 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CrxO54751 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CrxO54751 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CrxO54751 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CrxO54751 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CrxO54751 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CrxO54751 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CrxO54751 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CrxO54751 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CrxO54751 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CrxO54751 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CrxO54751 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CrxO54751 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CrxO54751 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CrxO54751 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CrxO54751 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CrxO54751 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CrxO54751 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CrxO54751 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CrxO54751 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CrxO54751 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CrxO54751 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CrxO54751 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CrxO54751 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CrxO54751 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CrxO54751 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CrxO54751 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CrxO54751 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CrxO54751 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CrxO54751 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CrxO54751 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CrxO54751 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CrxO54751 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CrxO54751 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CrxO54751 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CrxO54751 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CrxO54751 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CrxO54751 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CrxO54751 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CrxO54751 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CrxO54751 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CrxO54751 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CrxO54751 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CrxO54751 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CrxO54751 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CrxO54751 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CrxO54751 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CrxO54751 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CrxO54751 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CrxO54751 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CrxO54751 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CrxO54751 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CrxO54751 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CrxO54751 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CrxO54751 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CrxO54751 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CrxO54751 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CrxO54751 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CrxO54751 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CrxO54751 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CrxO54751 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CrxO54751 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CrxO54751 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CrxO54751 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms