Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LANCL1O43813 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LANCL1O43813 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LANCL1O43813 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LANCL1O43813 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LANCL1O43813 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LANCL1O43813 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LANCL1O43813 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LANCL1O43813 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LANCL1O43813 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LANCL1O43813 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LANCL1O43813 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LANCL1O43813 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LANCL1O43813 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LANCL1O43813 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LANCL1O43813 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LANCL1O43813 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LANCL1O43813 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LANCL1O43813 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LANCL1O43813 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LANCL1O43813 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LANCL1O43813 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LANCL1O43813 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LANCL1O43813 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.02■■□□□ 1.27
LANCL1O43813 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LANCL1O43813 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LANCL1O43813 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LANCL1O43813 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LANCL1O43813 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LANCL1O43813 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LANCL1O43813 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LANCL1O43813 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LANCL1O43813 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LANCL1O43813 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LANCL1O43813 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LANCL1O43813 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LANCL1O43813 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LANCL1O43813 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LANCL1O43813 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LANCL1O43813 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LANCL1O43813 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LANCL1O43813 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LANCL1O43813 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LANCL1O43813 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LANCL1O43813 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LANCL1O43813 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LANCL1O43813 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LANCL1O43813 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LANCL1O43813 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LANCL1O43813 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LANCL1O43813 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LANCL1O43813 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LANCL1O43813 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LANCL1O43813 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LANCL1O43813 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LANCL1O43813 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LANCL1O43813 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LANCL1O43813 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LANCL1O43813 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LANCL1O43813 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LANCL1O43813 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LANCL1O43813 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LANCL1O43813 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LANCL1O43813 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LANCL1O43813 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LANCL1O43813 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LANCL1O43813 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LANCL1O43813 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LANCL1O43813 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LANCL1O43813 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LANCL1O43813 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LANCL1O43813 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LANCL1O43813 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LANCL1O43813 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LANCL1O43813 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LANCL1O43813 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LANCL1O43813 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LANCL1O43813 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LANCL1O43813 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LANCL1O43813 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LANCL1O43813 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LANCL1O43813 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LANCL1O43813 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LANCL1O43813 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LANCL1O43813 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LANCL1O43813 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LANCL1O43813 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LANCL1O43813 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LANCL1O43813 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LANCL1O43813 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LANCL1O43813 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LANCL1O43813 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LANCL1O43813 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LANCL1O43813 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LANCL1O43813 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LANCL1O43813 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LANCL1O43813 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LANCL1O43813 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LANCL1O43813 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LANCL1O43813 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms