Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SGTAO43765 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SGTAO43765 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SGTAO43765 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SGTAO43765 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SGTAO43765 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SGTAO43765 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SGTAO43765 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SGTAO43765 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SGTAO43765 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SGTAO43765 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SGTAO43765 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SGTAO43765 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SGTAO43765 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SGTAO43765 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SGTAO43765 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SGTAO43765 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SGTAO43765 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SGTAO43765 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SGTAO43765 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SGTAO43765 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SGTAO43765 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SGTAO43765 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SGTAO43765 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SGTAO43765 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SGTAO43765 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SGTAO43765 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SGTAO43765 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SGTAO43765 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SGTAO43765 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SGTAO43765 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SGTAO43765 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SGTAO43765 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SGTAO43765 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SGTAO43765 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SGTAO43765 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SGTAO43765 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SGTAO43765 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SGTAO43765 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SGTAO43765 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SGTAO43765 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SGTAO43765 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SGTAO43765 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SGTAO43765 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SGTAO43765 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SGTAO43765 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SGTAO43765 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SGTAO43765 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SGTAO43765 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SGTAO43765 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SGTAO43765 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SGTAO43765 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SGTAO43765 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SGTAO43765 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SGTAO43765 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SGTAO43765 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SGTAO43765 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SGTAO43765 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SGTAO43765 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SGTAO43765 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SGTAO43765 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SGTAO43765 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SGTAO43765 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SGTAO43765 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SGTAO43765 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SGTAO43765 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SGTAO43765 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SGTAO43765 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SGTAO43765 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SGTAO43765 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SGTAO43765 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SGTAO43765 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SGTAO43765 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SGTAO43765 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SGTAO43765 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SGTAO43765 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SGTAO43765 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SGTAO43765 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SGTAO43765 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SGTAO43765 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SGTAO43765 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SGTAO43765 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SGTAO43765 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SGTAO43765 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SGTAO43765 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SGTAO43765 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SGTAO43765 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SGTAO43765 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SGTAO43765 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SGTAO43765 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SGTAO43765 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SGTAO43765 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SGTAO43765 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SGTAO43765 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SGTAO43765 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SGTAO43765 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SGTAO43765 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SGTAO43765 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SGTAO43765 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SGTAO43765 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms