Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNGR2O43760 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNGR2O43760 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNGR2O43760 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNGR2O43760 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNGR2O43760 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNGR2O43760 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNGR2O43760 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNGR2O43760 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNGR2O43760 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNGR2O43760 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNGR2O43760 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNGR2O43760 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNGR2O43760 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNGR2O43760 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNGR2O43760 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNGR2O43760 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNGR2O43760 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNGR2O43760 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNGR2O43760 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNGR2O43760 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNGR2O43760 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNGR2O43760 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNGR2O43760 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNGR2O43760 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNGR2O43760 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNGR2O43760 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNGR2O43760 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNGR2O43760 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNGR2O43760 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNGR2O43760 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNGR2O43760 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNGR2O43760 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNGR2O43760 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNGR2O43760 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNGR2O43760 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNGR2O43760 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNGR2O43760 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNGR2O43760 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNGR2O43760 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNGR2O43760 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNGR2O43760 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNGR2O43760 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNGR2O43760 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNGR2O43760 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNGR2O43760 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNGR2O43760 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNGR2O43760 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNGR2O43760 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNGR2O43760 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNGR2O43760 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNGR2O43760 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNGR2O43760 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNGR2O43760 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNGR2O43760 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNGR2O43760 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNGR2O43760 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNGR2O43760 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNGR2O43760 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNGR2O43760 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNGR2O43760 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNGR2O43760 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNGR2O43760 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNGR2O43760 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNGR2O43760 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNGR2O43760 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNGR2O43760 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNGR2O43760 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNGR2O43760 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNGR2O43760 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNGR2O43760 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNGR2O43760 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNGR2O43760 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNGR2O43760 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNGR2O43760 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SYNGR2O43760 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNGR2O43760 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
SYNGR2O43760 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNGR2O43760 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNGR2O43760 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNGR2O43760 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYNGR2O43760 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNGR2O43760 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SYNGR2O43760 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNGR2O43760 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYNGR2O43760 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYNGR2O43760 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SYNGR2O43760 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYNGR2O43760 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYNGR2O43760 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYNGR2O43760 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYNGR2O43760 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYNGR2O43760 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SYNGR2O43760 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYNGR2O43760 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYNGR2O43760 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYNGR2O43760 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYNGR2O43760 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYNGR2O43760 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYNGR2O43760 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms