Protein–RNA interactions for Protein: O43711

TLX3, T-cell leukemia homeobox protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLX3O43711 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TLX3O43711 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TLX3O43711 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TLX3O43711 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TLX3O43711 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TLX3O43711 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TLX3O43711 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TLX3O43711 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TLX3O43711 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TLX3O43711 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TLX3O43711 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TLX3O43711 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TLX3O43711 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TLX3O43711 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TLX3O43711 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TLX3O43711 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TLX3O43711 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TLX3O43711 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TLX3O43711 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TLX3O43711 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TLX3O43711 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TLX3O43711 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TLX3O43711 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TLX3O43711 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TLX3O43711 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TLX3O43711 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TLX3O43711 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TLX3O43711 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TLX3O43711 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TLX3O43711 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TLX3O43711 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TLX3O43711 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TLX3O43711 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TLX3O43711 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TLX3O43711 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TLX3O43711 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TLX3O43711 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TLX3O43711 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TLX3O43711 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TLX3O43711 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TLX3O43711 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TLX3O43711 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TLX3O43711 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TLX3O43711 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TLX3O43711 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TLX3O43711 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TLX3O43711 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TLX3O43711 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TLX3O43711 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TLX3O43711 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TLX3O43711 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TLX3O43711 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TLX3O43711 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TLX3O43711 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TLX3O43711 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TLX3O43711 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TLX3O43711 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TLX3O43711 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TLX3O43711 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TLX3O43711 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TLX3O43711 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TLX3O43711 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TLX3O43711 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TLX3O43711 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TLX3O43711 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TLX3O43711 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TLX3O43711 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TLX3O43711 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TLX3O43711 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TLX3O43711 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TLX3O43711 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TLX3O43711 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TLX3O43711 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TLX3O43711 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TLX3O43711 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TLX3O43711 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TLX3O43711 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TLX3O43711 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TLX3O43711 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TLX3O43711 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TLX3O43711 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TLX3O43711 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TLX3O43711 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TLX3O43711 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TLX3O43711 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TLX3O43711 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TLX3O43711 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TLX3O43711 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TLX3O43711 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TLX3O43711 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TLX3O43711 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TLX3O43711 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TLX3O43711 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TLX3O43711 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TLX3O43711 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TLX3O43711 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TLX3O43711 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TLX3O43711 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TLX3O43711 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TLX3O43711 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms