Protein–RNA interactions for Protein: O43679

LDB2, LIM domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB2O43679 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LDB2O43679 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LDB2O43679 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LDB2O43679 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LDB2O43679 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LDB2O43679 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LDB2O43679 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LDB2O43679 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LDB2O43679 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LDB2O43679 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LDB2O43679 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LDB2O43679 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LDB2O43679 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LDB2O43679 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LDB2O43679 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LDB2O43679 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LDB2O43679 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LDB2O43679 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LDB2O43679 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LDB2O43679 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LDB2O43679 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LDB2O43679 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
LDB2O43679 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
LDB2O43679 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LDB2O43679 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LDB2O43679 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LDB2O43679 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LDB2O43679 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LDB2O43679 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LDB2O43679 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LDB2O43679 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LDB2O43679 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LDB2O43679 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LDB2O43679 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LDB2O43679 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LDB2O43679 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LDB2O43679 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LDB2O43679 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LDB2O43679 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LDB2O43679 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LDB2O43679 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LDB2O43679 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LDB2O43679 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LDB2O43679 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LDB2O43679 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LDB2O43679 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LDB2O43679 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LDB2O43679 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LDB2O43679 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LDB2O43679 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LDB2O43679 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LDB2O43679 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LDB2O43679 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LDB2O43679 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LDB2O43679 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LDB2O43679 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LDB2O43679 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LDB2O43679 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LDB2O43679 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LDB2O43679 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LDB2O43679 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LDB2O43679 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LDB2O43679 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LDB2O43679 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LDB2O43679 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
LDB2O43679 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
LDB2O43679 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
LDB2O43679 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LDB2O43679 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LDB2O43679 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LDB2O43679 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LDB2O43679 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LDB2O43679 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LDB2O43679 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LDB2O43679 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LDB2O43679 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LDB2O43679 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LDB2O43679 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LDB2O43679 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LDB2O43679 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LDB2O43679 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LDB2O43679 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LDB2O43679 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LDB2O43679 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LDB2O43679 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LDB2O43679 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LDB2O43679 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LDB2O43679 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LDB2O43679 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LDB2O43679 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LDB2O43679 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
LDB2O43679 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LDB2O43679 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LDB2O43679 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LDB2O43679 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LDB2O43679 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LDB2O43679 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LDB2O43679 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LDB2O43679 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
LDB2O43679 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms