Protein–RNA interactions for Protein: O43674

NDUFB5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFB5O43674 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDUFB5O43674 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDUFB5O43674 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDUFB5O43674 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDUFB5O43674 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDUFB5O43674 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDUFB5O43674 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDUFB5O43674 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NDUFB5O43674 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NDUFB5O43674 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NDUFB5O43674 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NDUFB5O43674 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NDUFB5O43674 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NDUFB5O43674 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDUFB5O43674 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDUFB5O43674 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NDUFB5O43674 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDUFB5O43674 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDUFB5O43674 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDUFB5O43674 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NDUFB5O43674 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDUFB5O43674 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NDUFB5O43674 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NDUFB5O43674 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NDUFB5O43674 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NDUFB5O43674 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NDUFB5O43674 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NDUFB5O43674 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NDUFB5O43674 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NDUFB5O43674 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NDUFB5O43674 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NDUFB5O43674 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDUFB5O43674 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDUFB5O43674 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDUFB5O43674 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NDUFB5O43674 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NDUFB5O43674 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDUFB5O43674 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDUFB5O43674 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDUFB5O43674 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDUFB5O43674 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDUFB5O43674 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDUFB5O43674 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDUFB5O43674 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDUFB5O43674 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDUFB5O43674 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDUFB5O43674 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDUFB5O43674 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDUFB5O43674 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDUFB5O43674 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDUFB5O43674 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDUFB5O43674 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDUFB5O43674 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDUFB5O43674 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDUFB5O43674 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDUFB5O43674 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDUFB5O43674 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDUFB5O43674 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDUFB5O43674 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NDUFB5O43674 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDUFB5O43674 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDUFB5O43674 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDUFB5O43674 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDUFB5O43674 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NDUFB5O43674 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NDUFB5O43674 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDUFB5O43674 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDUFB5O43674 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDUFB5O43674 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDUFB5O43674 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDUFB5O43674 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDUFB5O43674 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDUFB5O43674 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDUFB5O43674 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NDUFB5O43674 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NDUFB5O43674 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDUFB5O43674 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDUFB5O43674 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDUFB5O43674 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDUFB5O43674 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDUFB5O43674 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDUFB5O43674 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDUFB5O43674 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDUFB5O43674 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDUFB5O43674 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NDUFB5O43674 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDUFB5O43674 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDUFB5O43674 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NDUFB5O43674 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDUFB5O43674 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDUFB5O43674 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDUFB5O43674 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDUFB5O43674 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDUFB5O43674 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NDUFB5O43674 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NDUFB5O43674 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NDUFB5O43674 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDUFB5O43674 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDUFB5O43674 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDUFB5O43674 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms