Protein–RNA interactions for Protein: O43657

TSPAN6, Tetraspanin-6, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN6O43657 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSPAN6O43657 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSPAN6O43657 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSPAN6O43657 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSPAN6O43657 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSPAN6O43657 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSPAN6O43657 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSPAN6O43657 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSPAN6O43657 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSPAN6O43657 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSPAN6O43657 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TSPAN6O43657 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TSPAN6O43657 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TSPAN6O43657 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TSPAN6O43657 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TSPAN6O43657 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TSPAN6O43657 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TSPAN6O43657 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TSPAN6O43657 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TSPAN6O43657 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TSPAN6O43657 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TSPAN6O43657 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TSPAN6O43657 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TSPAN6O43657 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TSPAN6O43657 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TSPAN6O43657 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSPAN6O43657 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSPAN6O43657 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSPAN6O43657 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TSPAN6O43657 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TSPAN6O43657 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TSPAN6O43657 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TSPAN6O43657 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TSPAN6O43657 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TSPAN6O43657 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TSPAN6O43657 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TSPAN6O43657 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TSPAN6O43657 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TSPAN6O43657 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSPAN6O43657 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TSPAN6O43657 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSPAN6O43657 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSPAN6O43657 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSPAN6O43657 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSPAN6O43657 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSPAN6O43657 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSPAN6O43657 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSPAN6O43657 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSPAN6O43657 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSPAN6O43657 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSPAN6O43657 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSPAN6O43657 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TSPAN6O43657 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TSPAN6O43657 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TSPAN6O43657 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSPAN6O43657 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSPAN6O43657 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSPAN6O43657 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSPAN6O43657 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TSPAN6O43657 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TSPAN6O43657 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TSPAN6O43657 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TSPAN6O43657 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TSPAN6O43657 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TSPAN6O43657 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TSPAN6O43657 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TSPAN6O43657 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TSPAN6O43657 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TSPAN6O43657 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TSPAN6O43657 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSPAN6O43657 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSPAN6O43657 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSPAN6O43657 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSPAN6O43657 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TSPAN6O43657 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TSPAN6O43657 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TSPAN6O43657 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TSPAN6O43657 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TSPAN6O43657 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TSPAN6O43657 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TSPAN6O43657 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TSPAN6O43657 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TSPAN6O43657 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TSPAN6O43657 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TSPAN6O43657 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TSPAN6O43657 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TSPAN6O43657 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TSPAN6O43657 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TSPAN6O43657 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TSPAN6O43657 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TSPAN6O43657 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TSPAN6O43657 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TSPAN6O43657 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TSPAN6O43657 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TSPAN6O43657 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TSPAN6O43657 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TSPAN6O43657 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TSPAN6O43657 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TSPAN6O43657 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TSPAN6O43657 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms