Protein–RNA interactions for Protein: O43529

CHST10, Carbohydrate sulfotransferase 10, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST10O43529 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHST10O43529 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHST10O43529 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHST10O43529 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHST10O43529 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CHST10O43529 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHST10O43529 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHST10O43529 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHST10O43529 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHST10O43529 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHST10O43529 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHST10O43529 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHST10O43529 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHST10O43529 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHST10O43529 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CHST10O43529 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHST10O43529 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHST10O43529 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHST10O43529 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHST10O43529 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHST10O43529 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHST10O43529 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHST10O43529 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHST10O43529 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHST10O43529 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHST10O43529 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHST10O43529 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHST10O43529 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHST10O43529 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHST10O43529 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHST10O43529 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHST10O43529 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHST10O43529 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CHST10O43529 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CHST10O43529 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHST10O43529 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHST10O43529 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHST10O43529 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CHST10O43529 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHST10O43529 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHST10O43529 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHST10O43529 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CHST10O43529 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHST10O43529 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHST10O43529 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHST10O43529 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHST10O43529 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHST10O43529 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHST10O43529 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHST10O43529 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CHST10O43529 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHST10O43529 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHST10O43529 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHST10O43529 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHST10O43529 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHST10O43529 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHST10O43529 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHST10O43529 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHST10O43529 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHST10O43529 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHST10O43529 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHST10O43529 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHST10O43529 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHST10O43529 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHST10O43529 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHST10O43529 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHST10O43529 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHST10O43529 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHST10O43529 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHST10O43529 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHST10O43529 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHST10O43529 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHST10O43529 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
CHST10O43529 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CHST10O43529 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHST10O43529 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHST10O43529 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHST10O43529 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHST10O43529 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHST10O43529 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHST10O43529 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHST10O43529 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHST10O43529 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHST10O43529 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHST10O43529 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHST10O43529 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHST10O43529 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHST10O43529 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHST10O43529 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHST10O43529 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHST10O43529 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHST10O43529 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHST10O43529 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHST10O43529 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHST10O43529 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHST10O43529 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHST10O43529 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHST10O43529 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHST10O43529 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHST10O43529 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms