Protein–RNA interactions for Protein: O43307

ARHGEF9, Rho guanine nucleotide exchange factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF9O43307 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGEF9O43307 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGEF9O43307 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGEF9O43307 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGEF9O43307 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGEF9O43307 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGEF9O43307 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGEF9O43307 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGEF9O43307 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGEF9O43307 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGEF9O43307 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGEF9O43307 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGEF9O43307 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGEF9O43307 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGEF9O43307 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGEF9O43307 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGEF9O43307 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGEF9O43307 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGEF9O43307 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGEF9O43307 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGEF9O43307 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGEF9O43307 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGEF9O43307 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGEF9O43307 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGEF9O43307 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGEF9O43307 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF9O43307 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGEF9O43307 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGEF9O43307 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGEF9O43307 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF9O43307 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGEF9O43307 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGEF9O43307 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARHGEF9O43307 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARHGEF9O43307 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGEF9O43307 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGEF9O43307 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARHGEF9O43307 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ARHGEF9O43307 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARHGEF9O43307 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARHGEF9O43307 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARHGEF9O43307 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARHGEF9O43307 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARHGEF9O43307 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF9O43307 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGEF9O43307 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGEF9O43307 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGEF9O43307 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGEF9O43307 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGEF9O43307 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGEF9O43307 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGEF9O43307 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGEF9O43307 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGEF9O43307 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGEF9O43307 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGEF9O43307 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGEF9O43307 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGEF9O43307 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGEF9O43307 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGEF9O43307 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGEF9O43307 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGEF9O43307 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGEF9O43307 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGEF9O43307 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGEF9O43307 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGEF9O43307 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGEF9O43307 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
ARHGEF9O43307 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARHGEF9O43307 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARHGEF9O43307 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARHGEF9O43307 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARHGEF9O43307 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARHGEF9O43307 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARHGEF9O43307 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARHGEF9O43307 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARHGEF9O43307 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARHGEF9O43307 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARHGEF9O43307 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ARHGEF9O43307 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARHGEF9O43307 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARHGEF9O43307 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ARHGEF9O43307 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARHGEF9O43307 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARHGEF9O43307 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ARHGEF9O43307 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ARHGEF9O43307 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARHGEF9O43307 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARHGEF9O43307 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ARHGEF9O43307 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARHGEF9O43307 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARHGEF9O43307 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARHGEF9O43307 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARHGEF9O43307 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARHGEF9O43307 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARHGEF9O43307 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARHGEF9O43307 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ARHGEF9O43307 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARHGEF9O43307 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARHGEF9O43307 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARHGEF9O43307 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms