Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SRGAP3O43295 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SRGAP3O43295 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SRGAP3O43295 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
SRGAP3O43295 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SRGAP3O43295 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SRGAP3O43295 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SRGAP3O43295 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SRGAP3O43295 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
SRGAP3O43295 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SRGAP3O43295 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SRGAP3O43295 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
SRGAP3O43295 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SRGAP3O43295 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SRGAP3O43295 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SRGAP3O43295 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SRGAP3O43295 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SRGAP3O43295 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SRGAP3O43295 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SRGAP3O43295 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SRGAP3O43295 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SRGAP3O43295 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
SRGAP3O43295 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SRGAP3O43295 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
SRGAP3O43295 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SRGAP3O43295 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SRGAP3O43295 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SRGAP3O43295 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SRGAP3O43295 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
SRGAP3O43295 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SRGAP3O43295 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SRGAP3O43295 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SRGAP3O43295 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
SRGAP3O43295 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SRGAP3O43295 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SRGAP3O43295 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SRGAP3O43295 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SRGAP3O43295 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SRGAP3O43295 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SRGAP3O43295 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SRGAP3O43295 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SRGAP3O43295 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SRGAP3O43295 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SRGAP3O43295 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SRGAP3O43295 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SRGAP3O43295 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
SRGAP3O43295 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SRGAP3O43295 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SRGAP3O43295 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SRGAP3O43295 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SRGAP3O43295 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SRGAP3O43295 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SRGAP3O43295 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SRGAP3O43295 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SRGAP3O43295 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SRGAP3O43295 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SRGAP3O43295 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SRGAP3O43295 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SRGAP3O43295 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SRGAP3O43295 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SRGAP3O43295 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SRGAP3O43295 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
SRGAP3O43295 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SRGAP3O43295 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SRGAP3O43295 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SRGAP3O43295 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SRGAP3O43295 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SRGAP3O43295 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SRGAP3O43295 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SRGAP3O43295 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SRGAP3O43295 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SRGAP3O43295 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SRGAP3O43295 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
SRGAP3O43295 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SRGAP3O43295 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SRGAP3O43295 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SRGAP3O43295 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SRGAP3O43295 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SRGAP3O43295 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SRGAP3O43295 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SRGAP3O43295 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SRGAP3O43295 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SRGAP3O43295 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SRGAP3O43295 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SRGAP3O43295 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
SRGAP3O43295 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SRGAP3O43295 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SRGAP3O43295 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SRGAP3O43295 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
SRGAP3O43295 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SRGAP3O43295 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
SRGAP3O43295 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SRGAP3O43295 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SRGAP3O43295 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SRGAP3O43295 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SRGAP3O43295 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SRGAP3O43295 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SRGAP3O43295 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SRGAP3O43295 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SRGAP3O43295 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms