Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NDUFS4O43181 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NDUFS4O43181 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NDUFS4O43181 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NDUFS4O43181 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NDUFS4O43181 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NDUFS4O43181 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NDUFS4O43181 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NDUFS4O43181 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NDUFS4O43181 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NDUFS4O43181 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NDUFS4O43181 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NDUFS4O43181 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NDUFS4O43181 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NDUFS4O43181 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NDUFS4O43181 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NDUFS4O43181 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NDUFS4O43181 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NDUFS4O43181 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NDUFS4O43181 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NDUFS4O43181 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NDUFS4O43181 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NDUFS4O43181 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NDUFS4O43181 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NDUFS4O43181 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NDUFS4O43181 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NDUFS4O43181 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NDUFS4O43181 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NDUFS4O43181 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NDUFS4O43181 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NDUFS4O43181 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NDUFS4O43181 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NDUFS4O43181 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NDUFS4O43181 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NDUFS4O43181 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NDUFS4O43181 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NDUFS4O43181 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NDUFS4O43181 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NDUFS4O43181 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NDUFS4O43181 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NDUFS4O43181 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NDUFS4O43181 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NDUFS4O43181 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDUFS4O43181 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NDUFS4O43181 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDUFS4O43181 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NDUFS4O43181 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NDUFS4O43181 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NDUFS4O43181 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NDUFS4O43181 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NDUFS4O43181 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NDUFS4O43181 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NDUFS4O43181 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NDUFS4O43181 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NDUFS4O43181 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NDUFS4O43181 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NDUFS4O43181 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NDUFS4O43181 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NDUFS4O43181 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NDUFS4O43181 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NDUFS4O43181 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NDUFS4O43181 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NDUFS4O43181 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NDUFS4O43181 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NDUFS4O43181 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NDUFS4O43181 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NDUFS4O43181 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NDUFS4O43181 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NDUFS4O43181 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NDUFS4O43181 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NDUFS4O43181 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NDUFS4O43181 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NDUFS4O43181 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NDUFS4O43181 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NDUFS4O43181 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NDUFS4O43181 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NDUFS4O43181 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NDUFS4O43181 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NDUFS4O43181 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NDUFS4O43181 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NDUFS4O43181 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NDUFS4O43181 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NDUFS4O43181 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NDUFS4O43181 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NDUFS4O43181 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NDUFS4O43181 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NDUFS4O43181 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NDUFS4O43181 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NDUFS4O43181 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NDUFS4O43181 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NDUFS4O43181 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NDUFS4O43181 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NDUFS4O43181 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NDUFS4O43181 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NDUFS4O43181 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NDUFS4O43181 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NDUFS4O43181 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NDUFS4O43181 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NDUFS4O43181 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NDUFS4O43181 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms