Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klf9O35739 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klf9O35739 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Klf9O35739 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klf9O35739 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klf9O35739 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klf9O35739 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klf9O35739 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klf9O35739 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klf9O35739 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klf9O35739 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klf9O35739 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klf9O35739 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klf9O35739 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klf9O35739 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klf9O35739 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klf9O35739 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klf9O35739 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klf9O35739 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klf9O35739 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Klf9O35739 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Klf9O35739 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Klf9O35739 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klf9O35739 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klf9O35739 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klf9O35739 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klf9O35739 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Klf9O35739 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klf9O35739 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klf9O35739 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klf9O35739 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klf9O35739 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klf9O35739 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klf9O35739 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klf9O35739 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Klf9O35739 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klf9O35739 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klf9O35739 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klf9O35739 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klf9O35739 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klf9O35739 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klf9O35739 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Klf9O35739 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Klf9O35739 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Klf9O35739 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Klf9O35739 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Klf9O35739 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Klf9O35739 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Klf9O35739 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Klf9O35739 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Klf9O35739 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Klf9O35739 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klf9O35739 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klf9O35739 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klf9O35739 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klf9O35739 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klf9O35739 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klf9O35739 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klf9O35739 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klf9O35739 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klf9O35739 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klf9O35739 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klf9O35739 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klf9O35739 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klf9O35739 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klf9O35739 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klf9O35739 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klf9O35739 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klf9O35739 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klf9O35739 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klf9O35739 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klf9O35739 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klf9O35739 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klf9O35739 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Klf9O35739 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Klf9O35739 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Klf9O35739 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klf9O35739 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klf9O35739 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klf9O35739 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klf9O35739 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klf9O35739 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klf9O35739 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Klf9O35739 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klf9O35739 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klf9O35739 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klf9O35739 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klf9O35739 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klf9O35739 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klf9O35739 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klf9O35739 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klf9O35739 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klf9O35739 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Klf9O35739 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klf9O35739 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klf9O35739 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klf9O35739 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klf9O35739 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klf9O35739 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Klf9O35739 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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