Protein–RNA interactions for Protein: O35137

Alx4, Homeobox protein aristaless-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx4O35137 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Alx4O35137 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Alx4O35137 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Alx4O35137 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Alx4O35137 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Alx4O35137 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Alx4O35137 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Alx4O35137 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Alx4O35137 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Alx4O35137 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Alx4O35137 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Alx4O35137 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Alx4O35137 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Alx4O35137 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Alx4O35137 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Alx4O35137 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Alx4O35137 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Alx4O35137 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Alx4O35137 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Alx4O35137 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Alx4O35137 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Alx4O35137 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Alx4O35137 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Alx4O35137 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Alx4O35137 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Alx4O35137 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Alx4O35137 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Alx4O35137 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Alx4O35137 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Alx4O35137 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Alx4O35137 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Alx4O35137 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Alx4O35137 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Alx4O35137 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Alx4O35137 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Alx4O35137 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Alx4O35137 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Alx4O35137 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Alx4O35137 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Alx4O35137 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Alx4O35137 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Alx4O35137 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Alx4O35137 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Alx4O35137 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Alx4O35137 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Alx4O35137 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Alx4O35137 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Alx4O35137 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Alx4O35137 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Alx4O35137 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Alx4O35137 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Alx4O35137 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Alx4O35137 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Alx4O35137 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Alx4O35137 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Alx4O35137 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Alx4O35137 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Alx4O35137 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Alx4O35137 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Alx4O35137 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Alx4O35137 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Alx4O35137 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Alx4O35137 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Alx4O35137 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Alx4O35137 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Alx4O35137 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Alx4O35137 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Alx4O35137 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Alx4O35137 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Alx4O35137 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Alx4O35137 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Alx4O35137 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Alx4O35137 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Alx4O35137 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Alx4O35137 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Alx4O35137 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Alx4O35137 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Alx4O35137 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Alx4O35137 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Alx4O35137 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Alx4O35137 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Alx4O35137 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Alx4O35137 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Alx4O35137 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Alx4O35137 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Alx4O35137 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Alx4O35137 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Alx4O35137 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Alx4O35137 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Alx4O35137 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Alx4O35137 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Alx4O35137 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Alx4O35137 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Alx4O35137 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Alx4O35137 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Alx4O35137 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Alx4O35137 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Alx4O35137 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Alx4O35137 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Alx4O35137 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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